25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7598 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  67.43 
 
 		 475 aa  676    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7598  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  966    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4135  WGR domain protein  61.75 
 
 		 475 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  46.91 
 
 		 615 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  44.32 
 
 		 1422 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  38.57 
 
 		 1440 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  49.12 
 
 		 1314 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3449  hypothetical protein  41.33 
 
 		 252 aa  53.5  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  43.1 
 
 		 1329 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  40.91 
 
 		 1822 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  27.27 
 
 		 1264 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  29.45 
 
 		 1262 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  28.77 
 
 		 1264 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  28.77 
 
 		 1264 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  26.26 
 
 		 352 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  28.77 
 
 		 1264 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  37.5 
 
 		 146 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  37.93 
 
 		 1838 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  36.21 
 
 		 1030 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  32.22 
 
 		 194 aa  47  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  23.3 
 
 		 774 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  40.68 
 
 		 1291 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  22.73 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  35.21 
 
 		 1822 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  41.43 
 
 		 1216 aa  43.9  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>