84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2883 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  43.16 
 
 		 1104 aa  706    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  41.63 
 
 		 1116 aa  667    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  100 
 
 		 1216 aa  2393    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  41.71 
 
 		 1130 aa  710    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  43.3 
 
 		 1127 aa  795    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  40.61 
 
 		 1314 aa  627  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  42.46 
 
 		 1099 aa  617  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  40.43 
 
 		 1083 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  38.57 
 
 		 1086 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  39.47 
 
 		 1012 aa  557  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  31.78 
 
 		 1262 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  31.59 
 
 		 1264 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  31.55 
 
 		 1264 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  31.4 
 
 		 1264 aa  512  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  31.05 
 
 		 1264 aa  509  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  37.14 
 
 		 988 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1422 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  36.69 
 
 		 1125 aa  483  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  35.03 
 
 		 1086 aa  465  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  40.82 
 
 		 963 aa  446  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  36.03 
 
 		 1055 aa  439  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  42.31 
 
 		 1329 aa  415  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  43.4 
 
 		 1001 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  42.44 
 
 		 1178 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  45.93 
 
 		 1297 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  35.2 
 
 		 1210 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  35.2 
 
 		 1210 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  36.57 
 
 		 1210 aa  367  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  36.08 
 
 		 1210 aa  365  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  35.92 
 
 		 1210 aa  363  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  34.59 
 
 		 1209 aa  355  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  35.88 
 
 		 1220 aa  353  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  40.16 
 
 		 1291 aa  338  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  29.66 
 
 		 971 aa  251  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  30.48 
 
 		 1137 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  27.95 
 
 		 1146 aa  182  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  29.48 
 
 		 1139 aa  180  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  29.46 
 
 		 1139 aa  175  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1139 aa  174  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1139 aa  170  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1108 aa  166  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.55 
 
 		 1275 aa  155  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1249 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  23.61 
 
 		 1094 aa  115  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  25.41 
 
 		 465 aa  111  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  18.41 
 
 		 903 aa  109  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  20.83 
 
 		 789 aa  97.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  20.07 
 
 		 898 aa  97.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  21.61 
 
 		 754 aa  87.8  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  21.25 
 
 		 857 aa  84  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  25 
 
 		 634 aa  79  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  19.54 
 
 		 762 aa  78.2  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  21.66 
 
 		 800 aa  77.8  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  29.01 
 
 		 817 aa  78.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  21.54 
 
 		 774 aa  76.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  52.11 
 
 		 1822 aa  73.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  26.64 
 
 		 837 aa  72.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  22.52 
 
 		 739 aa  72  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  24.26 
 
 		 852 aa  72  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  28.57 
 
 		 811 aa  70.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  47.69 
 
 		 1838 aa  64.7  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  30.84 
 
 		 1030 aa  62.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  25.74 
 
 		 670 aa  61.6  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  47.27 
 
 		 1440 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  22.56 
 
 		 862 aa  59.3  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  24.72 
 
 		 862 aa  57  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  37.18 
 
 		 1088 aa  55.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2071  WGR domain-containing protein  37.66 
 
 		 475 aa  52.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  40.26 
 
 		 146 aa  51.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4135  WGR domain protein  43.04 
 
 		 475 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  39.29 
 
 		 263 aa  49.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  48.33 
 
 		 194 aa  49.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  38.98 
 
 		 182 aa  49.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  42.11 
 
 		 1822 aa  48.5  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7598  hypothetical protein  41.43 
 
 		 480 aa  48.5  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  38.98 
 
 		 244 aa  48.1  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  38.98 
 
 		 244 aa  48.1  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  35.71 
 
 		 263 aa  48.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  35.71 
 
 		 263 aa  48.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3730  WGR domain-containing protein  37.97 
 
 		 113 aa  47.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  39.29 
 
 		 244 aa  46.2  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  39.29 
 
 		 244 aa  46.2  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1411  molybdate metabolism regulator  35.94 
 
 		 251 aa  46.2  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3449  hypothetical protein  42.11 
 
 		 252 aa  45.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>