62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02004 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  100 
 
 
1210 aa  2492    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  100 
 
 
1210 aa  2492    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  92.98 
 
 
1209 aa  2260    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  37.8 
 
 
1262 aa  684    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  91.97 
 
 
1220 aa  2248    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  37.55 
 
 
1264 aa  704    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  95.95 
 
 
1210 aa  2343    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  37.38 
 
 
1264 aa  699    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  37.69 
 
 
1264 aa  699    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  95.87 
 
 
1210 aa  2340    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  37.47 
 
 
1264 aa  701    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  96.61 
 
 
1210 aa  2365    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  32.96 
 
 
1422 aa  499  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  32.07 
 
 
963 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  35.2 
 
 
1216 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  34.64 
 
 
1130 aa  328  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  35.96 
 
 
1329 aa  327  9e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  33.87 
 
 
1127 aa  307  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  32.92 
 
 
1104 aa  299  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  32.15 
 
 
1291 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  33.33 
 
 
1083 aa  286  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  34.94 
 
 
1297 aa  285  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  35.44 
 
 
1314 aa  282  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  31.02 
 
 
1099 aa  275  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  33.39 
 
 
1012 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  31.71 
 
 
1116 aa  251  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  28.9 
 
 
1125 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  31.8 
 
 
1086 aa  244  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  33.61 
 
 
1001 aa  241  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  32.37 
 
 
1178 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  28.78 
 
 
1086 aa  228  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  32.78 
 
 
1055 aa  223  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  30.8 
 
 
988 aa  213  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  28.76 
 
 
1137 aa  156  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  27.21 
 
 
1139 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  28.06 
 
 
1139 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  25.53 
 
 
1146 aa  138  7.000000000000001e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  27.78 
 
 
1139 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  27.25 
 
 
1108 aa  137  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  27.78 
 
 
1139 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  26.71 
 
 
465 aa  122  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.38 
 
 
1275 aa  116  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  28.51 
 
 
1249 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  23.57 
 
 
898 aa  95.5  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  25.52 
 
 
971 aa  93.2  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  20.96 
 
 
1094 aa  92.8  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  19.22 
 
 
903 aa  88.6  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  25.52 
 
 
754 aa  82.4  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  23.55 
 
 
774 aa  78.6  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  21.78 
 
 
857 aa  78.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  26.53 
 
 
817 aa  76.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  21.53 
 
 
789 aa  74.7  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  20.07 
 
 
800 aa  72.8  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  25.83 
 
 
811 aa  73.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  20.21 
 
 
762 aa  65.5  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  22.47 
 
 
862 aa  65.5  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  22.38 
 
 
852 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  21.59 
 
 
670 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  20.52 
 
 
634 aa  52.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  18.5 
 
 
862 aa  51.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  18.75 
 
 
837 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  20.79 
 
 
739 aa  45.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0929812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>