62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2966 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  100 
 
 		 1083 aa  2099    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  48.87 
 
 		 1012 aa  733    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  40.91 
 
 		 1104 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  43.06 
 
 		 1099 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  40.43 
 
 		 1216 aa  594  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  39.14 
 
 		 1127 aa  552  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  40.09 
 
 		 1086 aa  547  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  38.07 
 
 		 1314 aa  538  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  38.76 
 
 		 1130 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  39.02 
 
 		 1116 aa  505  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  40.31 
 
 		 1264 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  40.16 
 
 		 1264 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  40 
 
 		 1264 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  41.44 
 
 		 1262 aa  399  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  39.84 
 
 		 1264 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  34.23 
 
 		 1125 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  36.08 
 
 		 988 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  40.1 
 
 		 963 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  40.05 
 
 		 1297 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  36.13 
 
 		 1055 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  39.49 
 
 		 1422 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  39.55 
 
 		 1329 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  35.54 
 
 		 1086 aa  360  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  42.16 
 
 		 1178 aa  340  9e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  41.14 
 
 		 1001 aa  327  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  39.84 
 
 		 1291 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  33.55 
 
 		 1210 aa  295  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  33.55 
 
 		 1210 aa  295  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  33.88 
 
 		 1210 aa  291  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  35.43 
 
 		 1209 aa  291  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  35.1 
 
 		 1220 aa  290  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  34.38 
 
 		 1210 aa  290  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  34.21 
 
 		 1210 aa  287  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  30.81 
 
 		 971 aa  159  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  29.78 
 
 		 1137 aa  156  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  27.07 
 
 		 1146 aa  151  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1139 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.9 
 
 		 1275 aa  147  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  27.62 
 
 		 1139 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1139 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  26.07 
 
 		 1139 aa  140  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1108 aa  135  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1249 aa  131  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  25.66 
 
 		 465 aa  107  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  19.5 
 
 		 903 aa  89.7  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  20.35 
 
 		 857 aa  85.9  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  22.04 
 
 		 1094 aa  85.9  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  21.04 
 
 		 800 aa  82  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  21.45 
 
 		 762 aa  81.6  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  28.63 
 
 		 817 aa  79.7  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  18.79 
 
 		 898 aa  77.4  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  22.22 
 
 		 754 aa  76.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  21.26 
 
 		 789 aa  71.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  25.31 
 
 		 634 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  27.8 
 
 		 837 aa  69.7  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  22.15 
 
 		 774 aa  67.8  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  29.45 
 
 		 811 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  23.92 
 
 		 739 aa  63.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  22.62 
 
 		 852 aa  62.4  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  18.31 
 
 		 862 aa  57  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  20.2 
 
 		 862 aa  49.3  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  23.58 
 
 		 670 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>