58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4266 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  100 
 
 		 971 aa  1846    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  39.28 
 
 		 1055 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1178 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1104 aa  328  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  34.1 
 
 		 1099 aa  322  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  30.14 
 
 		 1216 aa  287  8e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  32.99 
 
 		 1127 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1012 aa  264  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  31.07 
 
 		 1314 aa  259  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  29.31 
 
 		 1130 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1116 aa  215  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  27.8 
 
 		 1125 aa  210  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1083 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  30.05 
 
 		 988 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  28.96 
 
 		 1086 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  33.12 
 
 		 1086 aa  200  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  30.18 
 
 		 1264 aa  173  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  29.38 
 
 		 1262 aa  174  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  30.71 
 
 		 1264 aa  173  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  29.98 
 
 		 1264 aa  172  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  29.98 
 
 		 1264 aa  170  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  33.1 
 
 		 1291 aa  157  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  28.77 
 
 		 963 aa  150  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1210 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1210 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  27.85 
 
 		 1329 aa  145  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  27.47 
 
 		 1210 aa  141  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  27.47 
 
 		 1210 aa  138  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  27.47 
 
 		 1210 aa  138  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  25.71 
 
 		 1220 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  26.5 
 
 		 1209 aa  129  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  33.43 
 
 		 1422 aa  124  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1001 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  37.84 
 
 		 1297 aa  122  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  23.44 
 
 		 1146 aa  80.9  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1139 aa  79  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  29.87 
 
 		 1139 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  23.26 
 
 		 1137 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  27.43 
 
 		 465 aa  70.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  27.92 
 
 		 1139 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  21.26 
 
 		 1108 aa  66.2  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1139 aa  60.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  20.27 
 
 		 789 aa  59.3  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  18.62 
 
 		 898 aa  58.2  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  26.45 
 
 		 634 aa  57.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  21.16 
 
 		 800 aa  56.6  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1249 aa  57  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.54 
 
 		 1275 aa  57  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  21.71 
 
 		 754 aa  55.8  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  21.3 
 
 		 857 aa  55.5  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  28.95 
 
 		 739 aa  54.3  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  24.09 
 
 		 1094 aa  53.5  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  25.5 
 
 		 852 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  21.29 
 
 		 774 aa  52.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  31.9 
 
 		 817 aa  52  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  28.12 
 
 		 837 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2518  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1635 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.189661  normal  0.373256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3596  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1635 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>