57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3551 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  100 
 
 
670 aa  1300    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  34.59 
 
 
817 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  32.98 
 
 
811 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  32.73 
 
 
852 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  29.79 
 
 
739 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  31.64 
 
 
837 aa  174  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  26.92 
 
 
634 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3568  hypothetical protein  33.25 
 
 
697 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  26.51 
 
 
1139 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  26.55 
 
 
1139 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  26.46 
 
 
1137 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  30.1 
 
 
1099 aa  99  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3596  hypothetical protein  29.29 
 
 
1635 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2518  hypothetical protein  29.29 
 
 
1635 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.189661  normal  0.373256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  25.84 
 
 
1139 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  25.43 
 
 
1139 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  29.43 
 
 
1104 aa  88.6  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  29.6 
 
 
1086 aa  87.8  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.61 
 
 
1275 aa  80.1  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  26.64 
 
 
1127 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  21.86 
 
 
1249 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4129  hypothetical protein  24.24 
 
 
1675 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3835  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1638  hypothetical protein  25 
 
 
857 aa  72  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6953  hypothetical protein  32.75 
 
 
725 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448128  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  28.23 
 
 
1012 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5697  hypothetical protein  25.89 
 
 
802 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  22.65 
 
 
963 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  26.19 
 
 
1086 aa  64.3  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  18.75 
 
 
465 aa  63.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  25.44 
 
 
1216 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  28.96 
 
 
988 aa  60.1  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  24.75 
 
 
1422 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  24.51 
 
 
1125 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  18.87 
 
 
762 aa  59.7  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  17.14 
 
 
903 aa  59.3  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  21.72 
 
 
1329 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  27.41 
 
 
1178 aa  58.9  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  25.21 
 
 
1314 aa  58.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  23.51 
 
 
1130 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  18.75 
 
 
1146 aa  55.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  24.18 
 
 
1264 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  23.81 
 
 
1264 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  24.18 
 
 
1264 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  18.53 
 
 
1108 aa  54.7  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  21.96 
 
 
1210 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  21.96 
 
 
1210 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  21.93 
 
 
1210 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  21.59 
 
 
1210 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  21.96 
 
 
1209 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  21.61 
 
 
1262 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  21.59 
 
 
1210 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  21.61 
 
 
1264 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  21.62 
 
 
1220 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  24.15 
 
 
1001 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  24.3 
 
 
1116 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  23.58 
 
 
1083 aa  48.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7698  hypothetical protein  38.71 
 
 
424 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36205  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>