62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4404 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  50.05 
 
 		 1083 aa  761    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  100 
 
 		 1012 aa  1948    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  39.4 
 
 		 1216 aa  582  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  42.81 
 
 		 1099 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  41.11 
 
 		 1104 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  37.59 
 
 		 1127 aa  529  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  39.17 
 
 		 1314 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  37.89 
 
 		 1130 aa  485  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  40.1 
 
 		 1086 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1116 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  33.81 
 
 		 1125 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  38.51 
 
 		 1422 aa  366  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  38.01 
 
 		 1262 aa  365  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  38.5 
 
 		 1264 aa  364  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  38.5 
 
 		 1264 aa  364  6e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  36.41 
 
 		 988 aa  363  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  38.34 
 
 		 1264 aa  361  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  38.34 
 
 		 1264 aa  360  6e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  37.34 
 
 		 1055 aa  345  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  37.28 
 
 		 1329 aa  333  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  37.37 
 
 		 963 aa  330  8e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  35.83 
 
 		 1086 aa  327  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  42.08 
 
 		 1001 aa  321  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  44.13 
 
 		 1297 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  41.62 
 
 		 1178 aa  291  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  41.09 
 
 		 1291 aa  281  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  33.76 
 
 		 1210 aa  280  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  33.76 
 
 		 1210 aa  280  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  34.32 
 
 		 1210 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  35.14 
 
 		 1220 aa  274  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  34.32 
 
 		 1210 aa  272  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  34.13 
 
 		 1210 aa  269  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  34.32 
 
 		 1209 aa  266  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  33.37 
 
 		 971 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  26.37 
 
 		 1146 aa  153  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  29.58 
 
 		 1137 aa  144  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1139 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  29.27 
 
 		 1139 aa  137  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1139 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  27.19 
 
 		 1139 aa  131  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.89 
 
 		 1275 aa  130  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  24 
 
 		 1108 aa  127  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1249 aa  121  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  23.1 
 
 		 1094 aa  102  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  18.73 
 
 		 903 aa  92.8  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  24.17 
 
 		 465 aa  92  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  18.55 
 
 		 800 aa  80.1  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  25.79 
 
 		 634 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  19.42 
 
 		 857 aa  78.6  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  17.42 
 
 		 898 aa  78.2  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  20.29 
 
 		 762 aa  78.2  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  26.88 
 
 		 837 aa  74.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  19 
 
 		 754 aa  73.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  30.26 
 
 		 811 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  28.23 
 
 		 670 aa  68.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  27 
 
 		 817 aa  67.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  20.29 
 
 		 774 aa  66.2  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  20.49 
 
 		 789 aa  66.2  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  22.22 
 
 		 739 aa  57  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  19.61 
 
 		 862 aa  56.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  21.83 
 
 		 852 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4129  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1675 aa  45.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3835  normal  0.157034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>