61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1531 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  92.87 
 
 
1220 aa  2264    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  95.95 
 
 
1210 aa  2358    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  37.3 
 
 
1264 aa  692    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  93.88 
 
 
1209 aa  2277    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  37.66 
 
 
1262 aa  677    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  37.47 
 
 
1264 aa  696    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  100 
 
 
1210 aa  2486    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  37.47 
 
 
1264 aa  683    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  95.95 
 
 
1210 aa  2358    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  37.38 
 
 
1264 aa  693    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  98.84 
 
 
1210 aa  2456    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  99.67 
 
 
1210 aa  2478    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  33.15 
 
 
1422 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  32.42 
 
 
963 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  36.08 
 
 
1216 aa  369  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  35.24 
 
 
1130 aa  332  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  35.79 
 
 
1329 aa  322  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  34.54 
 
 
1127 aa  311  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  33.45 
 
 
1104 aa  303  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  34.38 
 
 
1083 aa  285  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  34.36 
 
 
1297 aa  279  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  31.23 
 
 
1291 aa  275  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  34.12 
 
 
1012 aa  275  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  31.53 
 
 
1099 aa  274  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  35.2 
 
 
1314 aa  273  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  32.51 
 
 
1116 aa  248  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  28.59 
 
 
1125 aa  247  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  32.17 
 
 
1086 aa  246  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  32.81 
 
 
1001 aa  241  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  29.42 
 
 
1086 aa  239  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  32.7 
 
 
1178 aa  233  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  38.18 
 
 
1055 aa  219  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  31.42 
 
 
988 aa  213  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  29.91 
 
 
1137 aa  152  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  28.33 
 
 
1139 aa  148  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  28.33 
 
 
1139 aa  144  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  27.78 
 
 
1139 aa  141  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  27.78 
 
 
1139 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  26.95 
 
 
1108 aa  136  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  24.92 
 
 
1146 aa  129  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.38 
 
 
1275 aa  115  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  28.19 
 
 
465 aa  114  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  27.66 
 
 
1249 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  20.36 
 
 
1094 aa  90.9  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  34.98 
 
 
971 aa  91.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  23.02 
 
 
898 aa  89.4  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  19.17 
 
 
903 aa  88.2  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  25.59 
 
 
817 aa  79  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  25.1 
 
 
754 aa  77  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  23.21 
 
 
774 aa  75.1  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  20.33 
 
 
857 aa  74.7  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  26.32 
 
 
811 aa  74.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  21.14 
 
 
789 aa  69.7  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  20.86 
 
 
800 aa  68.6  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  22.03 
 
 
862 aa  63.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  19.51 
 
 
762 aa  58.9  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  22.73 
 
 
852 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  21.96 
 
 
670 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  21.24 
 
 
634 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  20.61 
 
 
837 aa  51.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  23.91 
 
 
862 aa  50.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>