62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0597 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  45.7 
 
 
1125 aa  847    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  100 
 
 
1086 aa  2151    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  35.88 
 
 
1130 aa  509  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  35.33 
 
 
1216 aa  477  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  33.97 
 
 
1127 aa  477  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  31.81 
 
 
1104 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  33.04 
 
 
1086 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  33.71 
 
 
1099 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  33.33 
 
 
1116 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  35.54 
 
 
1083 aa  365  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  41.67 
 
 
1001 aa  363  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  35.93 
 
 
1264 aa  348  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  35.76 
 
 
1264 aa  347  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  36.29 
 
 
1262 aa  346  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  33.3 
 
 
1314 aa  345  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  35.76 
 
 
1264 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  35.6 
 
 
1264 aa  336  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  35.83 
 
 
1012 aa  331  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  34.73 
 
 
1422 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  34.74 
 
 
1055 aa  308  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  33.88 
 
 
963 aa  300  7e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  32.26 
 
 
988 aa  295  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  32.91 
 
 
1329 aa  288  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  36.78 
 
 
1291 aa  279  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  35.38 
 
 
1178 aa  251  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  36.29 
 
 
1297 aa  250  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  29.74 
 
 
1210 aa  249  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  29.42 
 
 
1210 aa  245  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  29.42 
 
 
1210 aa  244  7.999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  29.58 
 
 
1209 aa  242  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  28.78 
 
 
1210 aa  240  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  28.78 
 
 
1210 aa  240  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  31.2 
 
 
1220 aa  240  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  27.56 
 
 
1139 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  27.56 
 
 
1139 aa  165  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  27.56 
 
 
1139 aa  165  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  26.91 
 
 
1137 aa  163  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  26.83 
 
 
1139 aa  158  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  29.44 
 
 
971 aa  157  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  25.72 
 
 
1108 aa  156  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  25 
 
 
1146 aa  152  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  25.94 
 
 
1094 aa  138  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  27.03 
 
 
1249 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.29 
 
 
1275 aa  111  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  19.23 
 
 
903 aa  100  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  21.12 
 
 
465 aa  93.6  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  20.72 
 
 
898 aa  90.1  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  21.94 
 
 
857 aa  85.9  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  19.43 
 
 
789 aa  84  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  19.59 
 
 
800 aa  79  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  20.8 
 
 
774 aa  77  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  26.48 
 
 
817 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  20.45 
 
 
754 aa  73.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  28.38 
 
 
811 aa  71.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  25.35 
 
 
837 aa  70.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  26.19 
 
 
670 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  18.65 
 
 
762 aa  66.2  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  19.28 
 
 
862 aa  62  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  19.28 
 
 
862 aa  54.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  21.4 
 
 
739 aa  52.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  22.26 
 
 
852 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  21.47 
 
 
634 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>