63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1890 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  65.28 
 
 		 1099 aa  1258    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  64.19 
 
 		 1086 aa  1211    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  100 
 
 		 1104 aa  2142    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  43.54 
 
 		 1216 aa  709    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  40.34 
 
 		 1127 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  41.36 
 
 		 1083 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  42.2 
 
 		 1116 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  40.58 
 
 		 1314 aa  598  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  39.17 
 
 		 1130 aa  571  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  41.11 
 
 		 1012 aa  535  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  38.06 
 
 		 988 aa  489  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  37.27 
 
 		 1055 aa  442  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  33.74 
 
 		 1125 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  35.28 
 
 		 1264 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  35.28 
 
 		 1264 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  40.31 
 
 		 1262 aa  405  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  35.15 
 
 		 1264 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  35.02 
 
 		 1264 aa  405  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  32.14 
 
 		 1086 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  40.06 
 
 		 1422 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  33.6 
 
 		 1329 aa  390  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  40.16 
 
 		 1001 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  38.69 
 
 		 1178 aa  350  9e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  36.87 
 
 		 963 aa  344  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  36.5 
 
 		 1297 aa  335  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  38.74 
 
 		 1291 aa  332  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  32.24 
 
 		 1210 aa  301  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  32.92 
 
 		 1210 aa  299  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  32.92 
 
 		 1210 aa  299  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  32.24 
 
 		 1210 aa  296  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  31.72 
 
 		 1220 aa  295  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  32.07 
 
 		 1210 aa  293  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  33.27 
 
 		 1209 aa  292  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  33.08 
 
 		 971 aa  273  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1139 aa  180  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  29.12 
 
 		 1137 aa  179  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  30.59 
 
 		 1139 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  31.23 
 
 		 1139 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1139 aa  176  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1108 aa  169  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  26.98 
 
 		 1146 aa  162  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1249 aa  140  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.62 
 
 		 1275 aa  130  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  19.49 
 
 		 903 aa  105  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  33.33 
 
 		 817 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  21.76 
 
 		 465 aa  99  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  21.56 
 
 		 1094 aa  97.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  30.27 
 
 		 837 aa  95.1  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  23 
 
 		 754 aa  93.2  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  31.52 
 
 		 811 aa  89.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  29.43 
 
 		 670 aa  88.6  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  28.52 
 
 		 634 aa  81.6  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  24.91 
 
 		 739 aa  73.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  22.48 
 
 		 762 aa  74.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  25.44 
 
 		 852 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4129  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1675 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3835  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  18.21 
 
 		 898 aa  65.1  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  20.12 
 
 		 857 aa  64.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  17.92 
 
 		 800 aa  60.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  21.94 
 
 		 789 aa  61.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2518  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1635 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.189661  normal  0.373256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3596  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1635 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  20.22 
 
 		 774 aa  53.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>