62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3102 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  38.45 
 
 
1264 aa  721    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  92.98 
 
 
1210 aa  2277    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  38.09 
 
 
1264 aa  715    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  100 
 
 
1209 aa  2482    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  38.64 
 
 
1262 aa  699    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  91.23 
 
 
1220 aa  2212    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  93.88 
 
 
1210 aa  2276    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  38.38 
 
 
1264 aa  718    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  38.17 
 
 
1264 aa  716    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  92.98 
 
 
1210 aa  2277    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  94.05 
 
 
1210 aa  2279    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  93.8 
 
 
1210 aa  2273    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  31.87 
 
 
1422 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  32.85 
 
 
963 aa  476  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  34.59 
 
 
1216 aa  358  5e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  35.06 
 
 
1130 aa  326  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  36.3 
 
 
1329 aa  325  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  33.57 
 
 
1127 aa  308  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  33.27 
 
 
1104 aa  301  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  35.43 
 
 
1083 aa  286  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  33.81 
 
 
1297 aa  281  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  32.15 
 
 
1291 aa  277  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  31.35 
 
 
1099 aa  273  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  34.12 
 
 
1012 aa  269  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  34.45 
 
 
1314 aa  264  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  32.57 
 
 
1086 aa  254  8.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  31.88 
 
 
1116 aa  239  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  28.9 
 
 
1125 aa  239  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  29.58 
 
 
1086 aa  238  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  32.42 
 
 
1001 aa  233  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  32.16 
 
 
1178 aa  225  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  32.78 
 
 
1055 aa  216  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  31.21 
 
 
988 aa  209  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  30.2 
 
 
1137 aa  152  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  28.33 
 
 
1139 aa  145  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  28.33 
 
 
1139 aa  141  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  27.78 
 
 
1139 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  27.25 
 
 
1108 aa  137  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  27.78 
 
 
1139 aa  136  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  24.42 
 
 
1146 aa  134  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  27.75 
 
 
465 aa  117  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.46 
 
 
1275 aa  115  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  27.54 
 
 
1249 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  35 
 
 
971 aa  92  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  22.64 
 
 
898 aa  91.7  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  20.66 
 
 
1094 aa  91.7  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  19.17 
 
 
903 aa  88.2  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  25.1 
 
 
754 aa  79.7  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  26.09 
 
 
817 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  22.38 
 
 
857 aa  77  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  22.87 
 
 
774 aa  77  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  20.83 
 
 
789 aa  72.8  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  25.08 
 
 
811 aa  72  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  20.86 
 
 
800 aa  71.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  22.03 
 
 
862 aa  65.1  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  19.69 
 
 
762 aa  62  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  22.73 
 
 
852 aa  55.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  19.74 
 
 
634 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  21.96 
 
 
670 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  23.91 
 
 
862 aa  52.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  20.99 
 
 
837 aa  48.9  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5697  hypothetical protein  21.15 
 
 
802 aa  45.8  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>