69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4075 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  100 
 
 
634 aa  1327    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  30.91 
 
 
852 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  28.39 
 
 
837 aa  203  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  26.92 
 
 
817 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  26.29 
 
 
670 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  23.53 
 
 
739 aa  141  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  28.04 
 
 
811 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3568  hypothetical protein  27.5 
 
 
697 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  26.2 
 
 
1139 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  25.71 
 
 
1139 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  25.56 
 
 
1139 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  25.85 
 
 
1139 aa  87  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  24.32 
 
 
1137 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  25.67 
 
 
1146 aa  85.9  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  26.4 
 
 
465 aa  83.2  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  24.33 
 
 
1314 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  28.52 
 
 
1104 aa  81.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  28.57 
 
 
1099 aa  81.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  25.21 
 
 
1012 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  25 
 
 
1216 aa  79.7  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  24.72 
 
 
963 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5697  hypothetical protein  23.71 
 
 
802 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  23.48 
 
 
762 aa  75.5  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  22.02 
 
 
1249 aa  75.1  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  21.84 
 
 
754 aa  75.1  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  25.68 
 
 
1086 aa  73.9  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6953  hypothetical protein  24.78 
 
 
725 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448128  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4129  hypothetical protein  22.96 
 
 
1675 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3835  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  23.71 
 
 
1130 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  26.01 
 
 
1055 aa  71.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  25.31 
 
 
1083 aa  70.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.79 
 
 
1275 aa  70.5  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  21.97 
 
 
1127 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  22.38 
 
 
1108 aa  68.2  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  23.82 
 
 
1178 aa  67.4  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2518  hypothetical protein  24.65 
 
 
1635 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.189661  normal  0.373256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3596  hypothetical protein  24.65 
 
 
1635 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  21.11 
 
 
898 aa  66.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1638  hypothetical protein  26.19 
 
 
857 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  18.91 
 
 
789 aa  61.6  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  23.38 
 
 
1422 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  22.03 
 
 
1329 aa  59.7  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  22.34 
 
 
1291 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  24.64 
 
 
800 aa  59.3  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  24.2 
 
 
988 aa  58.9  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  22.43 
 
 
1262 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  22.49 
 
 
862 aa  55.1  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  19.74 
 
 
1209 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  23.79 
 
 
857 aa  54.7  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  19.47 
 
 
1210 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  19.47 
 
 
1210 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  19.47 
 
 
1210 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  21.19 
 
 
1210 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  21.19 
 
 
1210 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  22.43 
 
 
1264 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  19.25 
 
 
903 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  22.57 
 
 
1001 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  19.37 
 
 
1125 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  21.96 
 
 
1264 aa  52  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  21.96 
 
 
1264 aa  52  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  22.62 
 
 
862 aa  52  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  25 
 
 
1094 aa  51.2  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  20.85 
 
 
1220 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  21.13 
 
 
1264 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  21.83 
 
 
774 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  21.88 
 
 
1116 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7698  hypothetical protein  26.52 
 
 
424 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36205  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  21.74 
 
 
1086 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  26.45 
 
 
971 aa  44.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>