63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2909 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  100 
 
 		 1116 aa  2156    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  41.7 
 
 		 1216 aa  692    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  42.57 
 
 		 1104 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  41.53 
 
 		 1314 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  38.41 
 
 		 1127 aa  610  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  40.78 
 
 		 1130 aa  581  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  40.98 
 
 		 1099 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  41.79 
 
 		 1086 aa  552  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  38.76 
 
 		 1083 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  39.45 
 
 		 1012 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  37.89 
 
 		 988 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  35.39 
 
 		 1125 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  35.81 
 
 		 1264 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  36 
 
 		 1264 aa  429  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  35.69 
 
 		 1264 aa  426  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  35.88 
 
 		 1264 aa  426  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  34.41 
 
 		 1262 aa  416  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  36.5 
 
 		 1055 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  37.6 
 
 		 963 aa  383  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  33.55 
 
 		 1086 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  39.71 
 
 		 1422 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  43.03 
 
 		 1001 aa  358  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  39.36 
 
 		 1329 aa  352  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  39.8 
 
 		 1178 aa  335  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  40.35 
 
 		 1297 aa  332  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1210 aa  264  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1210 aa  264  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  37.84 
 
 		 1291 aa  260  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  32.51 
 
 		 1210 aa  257  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  32.09 
 
 		 1210 aa  256  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  32.51 
 
 		 1210 aa  256  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  34.07 
 
 		 1220 aa  251  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  31.88 
 
 		 1209 aa  248  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  29.49 
 
 		 971 aa  194  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1139 aa  155  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  28.15 
 
 		 1146 aa  151  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1139 aa  148  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  28.57 
 
 		 1139 aa  145  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  27.73 
 
 		 1137 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  27.86 
 
 		 1139 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1108 aa  135  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.32 
 
 		 1275 aa  134  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1249 aa  126  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  23.74 
 
 		 465 aa  90.5  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  23.51 
 
 		 1094 aa  86.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  16.76 
 
 		 903 aa  82.4  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  30.58 
 
 		 811 aa  81.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  28.95 
 
 		 817 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  18.94 
 
 		 762 aa  64.3  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  22.7 
 
 		 739 aa  63.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  20.1 
 
 		 789 aa  62.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  24.2 
 
 		 852 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  21.77 
 
 		 857 aa  60.1  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  21.24 
 
 		 774 aa  59.3  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  25.39 
 
 		 837 aa  58.9  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  18.65 
 
 		 754 aa  58.2  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  21.7 
 
 		 800 aa  56.2  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  20.51 
 
 		 898 aa  56.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  24.65 
 
 		 670 aa  53.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4129  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1675 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3835  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  22.98 
 
 		 634 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3596  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1635 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2518  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1635 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.189661  normal  0.373256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>