63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4309 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  100 
 
 		 1055 aa  1992    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  41.37 
 
 		 1314 aa  574  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  37.61 
 
 		 1104 aa  489  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  35.91 
 
 		 1216 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  47.51 
 
 		 1178 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  35.01 
 
 		 1127 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  38.6 
 
 		 1099 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  36.07 
 
 		 1130 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  39.06 
 
 		 1086 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  35.97 
 
 		 1116 aa  415  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  36.43 
 
 		 1083 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  36.6 
 
 		 971 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  37.17 
 
 		 1012 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  35.58 
 
 		 988 aa  353  8e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  32.47 
 
 		 1125 aa  345  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  36.29 
 
 		 1086 aa  341  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  36.6 
 
 		 1264 aa  326  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  36.6 
 
 		 1264 aa  321  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  36.25 
 
 		 1264 aa  319  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  36.08 
 
 		 1262 aa  318  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  36.43 
 
 		 1264 aa  318  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  38.74 
 
 		 1329 aa  318  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  39.28 
 
 		 1001 aa  313  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  37.85 
 
 		 1422 aa  304  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  43.73 
 
 		 1297 aa  291  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  41.23 
 
 		 1291 aa  290  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  34.4 
 
 		 963 aa  279  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  32.64 
 
 		 1210 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  32.64 
 
 		 1210 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  34.46 
 
 		 1210 aa  239  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  35.18 
 
 		 1220 aa  239  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  34.86 
 
 		 1210 aa  237  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  34.86 
 
 		 1210 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  35.04 
 
 		 1209 aa  233  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  27.67 
 
 		 1137 aa  160  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1139 aa  156  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  25.96 
 
 		 1139 aa  151  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  26.14 
 
 		 1139 aa  151  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1139 aa  147  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  30.31 
 
 		 1146 aa  146  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1108 aa  128  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.59 
 
 		 1275 aa  117  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  22.41 
 
 		 1094 aa  106  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1249 aa  103  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  25.61 
 
 		 465 aa  100  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  17.05 
 
 		 903 aa  84.3  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  29.89 
 
 		 817 aa  79  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  22.41 
 
 		 898 aa  77.8  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  24.64 
 
 		 789 aa  77.4  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  20.93 
 
 		 754 aa  77.8  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  25.85 
 
 		 634 aa  75.5  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  21.75 
 
 		 762 aa  73.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  29.68 
 
 		 811 aa  67.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  20.68 
 
 		 800 aa  63.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  28.57 
 
 		 857 aa  63.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  25.18 
 
 		 852 aa  62.4  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  25.98 
 
 		 774 aa  62  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  24.58 
 
 		 837 aa  61.6  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  25.45 
 
 		 670 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  22.19 
 
 		 739 aa  52.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4129  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1675 aa  52  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3835  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3596  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1635 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2518  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1635 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.189661  normal  0.373256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>