60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0927 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  100 
 
 		 1220 aa  2516    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  91.97 
 
 		 1210 aa  2274    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  37.37 
 
 		 1264 aa  703    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  91.23 
 
 		 1209 aa  2228    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  37.34 
 
 		 1262 aa  683    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  37.54 
 
 		 1264 aa  708    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  92.87 
 
 		 1210 aa  2277    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  37.53 
 
 		 1264 aa  705    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  92.79 
 
 		 1210 aa  2274    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  37.46 
 
 		 1264 aa  704    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  93.11 
 
 		 1210 aa  2281    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  91.97 
 
 		 1210 aa  2274    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  33.55 
 
 		 1422 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  32.33 
 
 		 963 aa  479  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  35.88 
 
 		 1216 aa  356  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  35.42 
 
 		 1130 aa  333  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  36.3 
 
 		 1329 aa  330  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  35.1 
 
 		 1127 aa  318  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  32.92 
 
 		 1104 aa  301  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  35.37 
 
 		 1083 aa  285  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  33.43 
 
 		 1297 aa  279  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  31.08 
 
 		 1291 aa  275  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1012 aa  276  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  36.67 
 
 		 1314 aa  275  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  33.33 
 
 		 1099 aa  274  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  32.32 
 
 		 1086 aa  246  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1116 aa  244  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  29.78 
 
 		 1125 aa  240  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  31.2 
 
 		 1086 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1178 aa  236  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1001 aa  232  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  33.2 
 
 		 1055 aa  226  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  31.1 
 
 		 988 aa  212  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  28.49 
 
 		 1137 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  26.94 
 
 		 1139 aa  138  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1139 aa  136  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1108 aa  136  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1139 aa  135  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  26.94 
 
 		 1139 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  25.9 
 
 		 1146 aa  130  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.04 
 
 		 1275 aa  117  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  27.31 
 
 		 465 aa  112  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1249 aa  110  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  35.5 
 
 		 971 aa  93.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  20.66 
 
 		 1094 aa  92.4  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  19.17 
 
 		 903 aa  91.3  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  22.26 
 
 		 898 aa  87  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  26.53 
 
 		 817 aa  80.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  22.87 
 
 		 774 aa  78.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  21.34 
 
 		 857 aa  76.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  23.85 
 
 		 754 aa  75.5  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  25.83 
 
 		 811 aa  74.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  20.83 
 
 		 789 aa  72.8  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  20.9 
 
 		 800 aa  68.9  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  20.65 
 
 		 862 aa  65.5  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  19.4 
 
 		 762 aa  59.3  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  22.38 
 
 		 852 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  25 
 
 		 862 aa  53.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  21.62 
 
 		 670 aa  52.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  20.85 
 
 		 634 aa  51.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>