63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1541 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  37.55 
 
 		 1264 aa  687    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  94.05 
 
 		 1209 aa  2281    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  96.61 
 
 		 1210 aa  2380    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  37.88 
 
 		 1262 aa  681    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  93.11 
 
 		 1220 aa  2271    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  37.5 
 
 		 1264 aa  684    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  98.84 
 
 		 1210 aa  2456    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  98.68 
 
 		 1210 aa  2450    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  37.42 
 
 		 1264 aa  682    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  37.33 
 
 		 1264 aa  680    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  100 
 
 		 1210 aa  2489    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  96.61 
 
 		 1210 aa  2380    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  33.36 
 
 		 1422 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  32.42 
 
 		 963 aa  479  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  36.57 
 
 		 1216 aa  370  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  34.95 
 
 		 1130 aa  334  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  35.96 
 
 		 1329 aa  328  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  33.75 
 
 		 1127 aa  315  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  33.45 
 
 		 1104 aa  308  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  34.05 
 
 		 1083 aa  286  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  34.62 
 
 		 1297 aa  281  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  34.12 
 
 		 1012 aa  279  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  31.52 
 
 		 1099 aa  277  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  30.91 
 
 		 1291 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  34.82 
 
 		 1314 aa  275  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  32.35 
 
 		 1086 aa  252  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1116 aa  248  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  28.75 
 
 		 1125 aa  248  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1001 aa  244  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  29.74 
 
 		 1086 aa  244  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1178 aa  235  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  32.78 
 
 		 1055 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  31.42 
 
 		 988 aa  215  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  27.91 
 
 		 1137 aa  151  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  27.18 
 
 		 1139 aa  147  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1139 aa  145  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1139 aa  145  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1108 aa  140  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  27.5 
 
 		 1139 aa  137  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  24.92 
 
 		 1146 aa  133  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.54 
 
 		 1275 aa  115  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  25.63 
 
 		 465 aa  115  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1249 aa  110  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  20.66 
 
 		 1094 aa  94.4  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  35 
 
 		 971 aa  93.2  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  19.44 
 
 		 903 aa  92.4  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  23.02 
 
 		 898 aa  92.4  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  25.1 
 
 		 754 aa  79.7  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  26.53 
 
 		 817 aa  79  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  23.21 
 
 		 774 aa  77  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  20.49 
 
 		 857 aa  77  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  25.5 
 
 		 811 aa  73.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  21.18 
 
 		 789 aa  73.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  20.14 
 
 		 800 aa  70.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  22.03 
 
 		 862 aa  64.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  19.51 
 
 		 762 aa  60.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  22.73 
 
 		 852 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  21.93 
 
 		 670 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  20 
 
 		 634 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  21.37 
 
 		 837 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  23.91 
 
 		 862 aa  50.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  20.5 
 
 		 739 aa  45.8  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5697  hypothetical protein  21.15 
 
 		 802 aa  44.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>