62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1935 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  100 
 
 
837 aa  1705    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  49.28 
 
 
852 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  42.44 
 
 
817 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  36.72 
 
 
739 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  38.6 
 
 
811 aa  344  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3568  hypothetical protein  42.02 
 
 
697 aa  261  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  28.39 
 
 
634 aa  203  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  31.73 
 
 
670 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2518  hypothetical protein  27.63 
 
 
1635 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.189661  normal  0.373256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3596  hypothetical protein  27.63 
 
 
1635 aa  121  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4129  hypothetical protein  27.1 
 
 
1675 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3835  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  26.21 
 
 
1139 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  25.95 
 
 
1137 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  30.27 
 
 
1104 aa  95.1  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  24.61 
 
 
1139 aa  93.6  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  25.22 
 
 
1139 aa  94  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  24.67 
 
 
1139 aa  92  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  28.67 
 
 
1099 aa  85.5  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  24.03 
 
 
1146 aa  75.1  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  26.88 
 
 
1012 aa  74.3  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  28.16 
 
 
1422 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  26.64 
 
 
1216 aa  72.4  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  24.39 
 
 
1108 aa  71.6  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  25.4 
 
 
1130 aa  71.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  23.61 
 
 
1249 aa  71.2  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  27.8 
 
 
1083 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  21.99 
 
 
1275 aa  69.3  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  24.84 
 
 
1329 aa  68.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  23.53 
 
 
465 aa  67  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  24.32 
 
 
1127 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  28.7 
 
 
1178 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5697  hypothetical protein  26.22 
 
 
802 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  21.68 
 
 
1094 aa  62.4  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6953  hypothetical protein  25.06 
 
 
725 aa  62  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448128  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  28.34 
 
 
1055 aa  60.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  24.91 
 
 
1264 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  26.15 
 
 
1125 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  27.37 
 
 
1291 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  25.3 
 
 
1262 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  25.3 
 
 
1264 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  19.66 
 
 
754 aa  58.5  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  24.9 
 
 
1264 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  23.97 
 
 
963 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  25.75 
 
 
1086 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  24.9 
 
 
1264 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  27.56 
 
 
1086 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  25.39 
 
 
1116 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  26.04 
 
 
1297 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1638  hypothetical protein  25.41 
 
 
857 aa  54.7  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  21.63 
 
 
1314 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  21.37 
 
 
1210 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  18.84 
 
 
762 aa  52  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  23.93 
 
 
988 aa  51.6  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  20.61 
 
 
1210 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  22.9 
 
 
774 aa  49.3  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  20.99 
 
 
1209 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  19.21 
 
 
898 aa  48.5  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  20.23 
 
 
1210 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7698  hypothetical protein  34.21 
 
 
424 aa  48.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36205  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  18.15 
 
 
903 aa  47  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  18.75 
 
 
1210 aa  47.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  18.75 
 
 
1210 aa  47.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>