16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1638 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1638  hypothetical protein  100 
 
 		 857 aa  1766    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3596  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1635 aa  161  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2518  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1635 aa  161  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.189661  normal  0.373256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4129  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1675 aa  144  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3835  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  24.23 
 
 		 739 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  26.9 
 
 		 817 aa  76.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  25 
 
 		 670 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  25.71 
 
 		 811 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3568  hypothetical protein  23.96 
 
 		 697 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  26.19 
 
 		 634 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  25.41 
 
 		 837 aa  54.7  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1001 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  24.46 
 
 		 852 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5697  hypothetical protein  25.61 
 
 		 802 aa  48.5  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6953  hypothetical protein  24.69 
 
 		 725 aa  45.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448128  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  25 
 
 		 1104 aa  44.3  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>