20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6953 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5697  hypothetical protein  87.57 
 
 
802 aa  1153    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6953  hypothetical protein  100 
 
 
725 aa  1426    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448128  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3568  hypothetical protein  30.88 
 
 
697 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7057  hypothetical protein  84.71 
 
 
85 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.601678  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  24.8 
 
 
739 aa  88.6  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  24.78 
 
 
634 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  24.71 
 
 
852 aa  77.8  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  24.38 
 
 
817 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  26.36 
 
 
811 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  24.62 
 
 
837 aa  70.1  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  27.17 
 
 
670 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3596  hypothetical protein  28.52 
 
 
1635 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2518  hypothetical protein  28.52 
 
 
1635 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.189661  normal  0.373256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4129  hypothetical protein  23.74 
 
 
1675 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3835  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  29.24 
 
 
1314 aa  54.7  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  23.75 
 
 
1275 aa  50.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  24.41 
 
 
1139 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  23.24 
 
 
1137 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  24.3 
 
 
1139 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1638  hypothetical protein  24.53 
 
 
857 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>