13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7698 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7698  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  818    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36205  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  31.25 
 
 
817 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  22.97 
 
 
634 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  21.54 
 
 
1139 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  29.51 
 
 
811 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  25.99 
 
 
837 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  21.48 
 
 
739 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  38.71 
 
 
670 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  21.95 
 
 
1139 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  24.81 
 
 
852 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  22.31 
 
 
1139 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  21.22 
 
 
1139 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  23.64 
 
 
1130 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>