28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02320 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02320  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  511  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.277615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02281  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  511  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1241  WGR domain protein  96.72 
 
 		 244 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2555  WGR domain-containing protein  96.72 
 
 		 244 aa  495  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0359836  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1411  molybdate metabolism regulator  37.4 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1957  WGR domain-containing protein  37.13 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4350  WGR domain protein  60.87 
 
 		 1440 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0376935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3049  WGR domain family  42.35 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4733  WGR domain-containing protein  50 
 
 		 1030 aa  69.3  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2201  WGR domain family  50.77 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.872029  hitchhiker  0.0000000000331862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2832  WGR domain-containing protein  50.77 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0136828  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  45.59 
 
 		 1264 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  47.06 
 
 		 1262 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0857  WGR domain family  47.14 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1822 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  47.06 
 
 		 1264 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  47.06 
 
 		 1264 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  47.06 
 
 		 1264 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  47.54 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  42.59 
 
 		 1329 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  42.86 
 
 		 1838 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  40.3 
 
 		 1088 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  41.27 
 
 		 1822 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  42.37 
 
 		 1314 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0896  hypothetical protein  43.64 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0155948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1422 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  32.31 
 
 		 182 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3449  hypothetical protein  40.82 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>