More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4319 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4319  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 306 aa  628  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414094  normal  0.0857311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3644  transcriptional regulator, AraC family  73.2 
 
 		 306 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0477  helix-turn-helix domain-containing protein  53.82 
 
 		 304 aa  336  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2655  transcriptional regulator, AraC family  52.98 
 
 		 304 aa  331  9e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.5275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1308  helix-turn-helix domain-containing protein  50.83 
 
 		 306 aa  323  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1859  transcriptional regulator, AraC family  52.43 
 
 		 306 aa  321  8e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5133  transcriptional regulator, AraC family  50.98 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0705999  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1989  AraC family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 301 aa  317  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.116886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4692  helix-turn-helix domain-containing protein  51.33 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5664  transcriptional regulator, AraC family  51.84 
 
 		 305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.169654  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2093  transcriptional regulator, AraC family  51.66 
 
 		 306 aa  311  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4017  transcriptional regulator, AraC family  51.62 
 
 		 306 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176614  hitchhiker  0.00151279 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2347  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  53.16 
 
 		 299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  0.205256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3135  transcriptional regulator, AraC family  49.83 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5696  transcriptional regulator, AraC family  48.32 
 
 		 301 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2111  transcriptional regulator, AraC family  48.81 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0317919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5616  transcriptional regulator, AraC family  51.52 
 
 		 306 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3745  helix-turn-helix domain-containing protein  52.03 
 
 		 303 aa  299  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0841  transcriptional regulator, AraC family  50.49 
 
 		 302 aa  298  8e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489932  normal  0.458947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5730  transcriptional regulator, AraC family  47.46 
 
 		 305 aa  296  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.861702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3816  transcriptional regulator, AraC family  48.84 
 
 		 302 aa  295  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000942469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2324  helix-turn-helix domain-containing protein  49.67 
 
 		 306 aa  292  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6699  transcriptional regulator, AraC family  47.85 
 
 		 303 aa  292  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0313  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  47.54 
 
 		 311 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.593516  normal  0.0908723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2529  transcriptional regulator, AraC family  49.5 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4324  transcriptional regulator, AraC family  50.33 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4380  transcriptional regulator, AraC family  48.99 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.072515  decreased coverage  0.000817798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4108  transcriptional regulator, AraC family  47.39 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2643  transcriptional regulator, AraC family  49.5 
 
 		 305 aa  285  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0795381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1767  transcriptional regulator, AraC family  49.84 
 
 		 300 aa  281  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2468  transcriptional regulator, AraC family  48.3 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6274  transcriptional regulator, AraC family  47.08 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6134  transcriptional regulator, AraC family  47.71 
 
 		 305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3525  transcriptional regulator, AraC family  46.56 
 
 		 305 aa  268  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2714  transcriptional regulator, AraC family  46.46 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10093  putative AraC family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 304 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6183  transcriptional regulator, AraC family  43.99 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0614415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1405  transcriptional regulator, AraC family  43.15 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.099769  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6702  transcriptional regulator, AraC family  43.73 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4836  transcriptional regulator, AraC family  41.44 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335383  hitchhiker  0.00000110136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  45.09 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3787  transcriptional regulator, AraC family  42.75 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0143656 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00465  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1306  transcriptional regulator, AraC family  38.01 
 
 		 305 aa  225  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.272206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2759  transcriptional regulator, AraC family  40.64 
 
 		 300 aa  221  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1007  transcriptional regulator, AraC family  40.07 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5741  transcriptional regulator, AraC family  38.01 
 
 		 295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3929  transcriptional regulator, AraC family  36.7 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2180  transcriptional regulator, AraC family  38.85 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.20744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2240  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4603  transcriptional regulator, AraC family  53.09 
 
 		 87 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.463016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0275  transcriptional regulator, AraC family  27.06 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0485  transcriptional regulator, AraC family  25.87 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1751  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4278  helix-turn-helix domain-containing protein  26.25 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1949  transcriptional regulator, AraC family  25.11 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1694  transcriptional regulator, AraC family  23.26 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  24.78 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  27.43 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7190  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0470  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1738  transcriptional regulator, AraC family  34.27 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0890  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.61 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  23.69 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3804  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0667593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3758  transcriptional regulator, AraC family  22.68 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  26.76 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5379  transcriptional regulator, AraC family  24.4 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0180  helix-turn-helix domain-containing protein  28.03 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3756  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4019  transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.992917  hitchhiker  0.00536454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0769  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636487  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  27.41 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6762  transcriptional regulator, AraC family  24.02 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2696  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0346  AraC family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4701  transcriptional regulator, AraC family  25.5 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0383  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4241  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.82932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4132  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3374  helix-turn-helix domain-containing protein  23.32 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5452  transcriptional regulator, AraC family  37.18 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662844  normal  0.250366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6379  transcriptional regulator, AraC family  22.4 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0873  transcriptional regulator, AraC family  24.5 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3768  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5317  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.803525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6093  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6061  transcriptional regulator, AraC family  25.21 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2211  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2965  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000197043  hitchhiker  0.00000564139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0730  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 115 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2146  transcriptional regulator, AraC family  39.51 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00502673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7131  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3534  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0611769  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1116  transcriptional regulator, AraC family  23.83 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.49707  normal  0.304596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1351  transcriptional regulator, AraC family  28.19 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3181  transcriptional regulator, AraC family  24.31 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>