More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2496 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 785 aa  1603    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  43.72 
 
 		 789 aa  624  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  44.43 
 
 		 810 aa  613  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  41.68 
 
 		 786 aa  608  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  40.61 
 
 		 782 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  42.05 
 
 		 852 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  40.78 
 
 		 907 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  38.96 
 
 		 810 aa  522  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  38.92 
 
 		 769 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  38.81 
 
 		 809 aa  518  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  38.71 
 
 		 767 aa  510  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  39.08 
 
 		 795 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  36.04 
 
 		 806 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 816 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  35.29 
 
 		 808 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 812 aa  274  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  29.72 
 
 		 793 aa  251  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 809 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 805 aa  248  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 824 aa  240  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 776 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 795 aa  231  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 837 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 789 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 791 aa  227  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 850 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 786 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 807 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 		 814 aa  208  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 817 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 859 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  25.57 
 
 		 843 aa  203  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 730 aa  201  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.3 
 
 		 703 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 862 aa  197  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 715 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 794 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 806 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  25.68 
 
 		 792 aa  194  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 864 aa  194  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 726 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 726 aa  190  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 771 aa  190  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 815 aa  190  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 767 aa  190  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 860 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 708 aa  188  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.16 
 
 		 708 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 825 aa  187  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 689 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 741 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 825 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.32 
 
 		 711 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 708 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  23.53 
 
 		 743 aa  183  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2280  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 742 aa  181  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 730 aa  180  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 771 aa  178  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.68 
 
 		 696 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 		 769 aa  177  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 707 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 743 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 696 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 722 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 		 701 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 781 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 799 aa  174  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  23.83 
 
 		 709 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 792 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 779 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.09 
 
 		 703 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  25.52 
 
 		 680 aa  169  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 750 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  25.81 
 
 		 729 aa  168  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 743 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.65 
 
 		 711 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  25.87 
 
 		 752 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 747 aa  165  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 719 aa  165  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  26.1 
 
 		 745 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  26.1 
 
 		 747 aa  164  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  26.1 
 
 		 747 aa  164  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  26.1 
 
 		 747 aa  164  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  26.3 
 
 		 696 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 713 aa  164  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  25.07 
 
 		 689 aa  163  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 703 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 753 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 794 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 696 aa  163  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  24.27 
 
 		 801 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 710 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 820 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  25.12 
 
 		 692 aa  162  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  26.3 
 
 		 698 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  25.2 
 
 		 747 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 709 aa  161  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 718 aa  161  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  26.16 
 
 		 696 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 829 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>