More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0834 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 650 aa  1344    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  65.69 
 
 		 653 aa  899    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  72.9 
 
 		 655 aa  971    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  70.45 
 
 		 659 aa  947    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  50.38 
 
 		 617 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  47.85 
 
 		 617 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  45.62 
 
 		 619 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  34.73 
 
 		 624 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  34.89 
 
 		 662 aa  300  7e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  34.71 
 
 		 646 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  29.62 
 
 		 527 aa  193  8e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  29.8 
 
 		 609 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  27.22 
 
 		 599 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  28.9 
 
 		 614 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  26.72 
 
 		 593 aa  154  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  28.24 
 
 		 622 aa  154  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.24 
 
 		 1891 aa  148  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  28.67 
 
 		 600 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 		 1017 aa  145  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  26.03 
 
 		 1005 aa  145  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  26.77 
 
 		 925 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  26.91 
 
 		 838 aa  139  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.28 
 
 		 1975 aa  139  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.01 
 
 		 1942 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.93 
 
 		 2068 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.67 
 
 		 1855 aa  138  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  25.09 
 
 		 604 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  22.17 
 
 		 836 aa  130  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  25.65 
 
 		 885 aa  123  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  24.86 
 
 		 610 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  25.47 
 
 		 526 aa  107  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  39.02 
 
 		 1021 aa  103  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  25.6 
 
 		 723 aa  102  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  22.86 
 
 		 649 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  24.09 
 
 		 814 aa  100  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  26.85 
 
 		 2638 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  33.78 
 
 		 510 aa  99  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  23.2 
 
 		 774 aa  97.8  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  22.81 
 
 		 765 aa  97.8  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  32.1 
 
 		 511 aa  96.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  36.48 
 
 		 484 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  25.7 
 
 		 752 aa  96.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  24.73 
 
 		 786 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04420  alpha-1,3-glucan synthase, putative  27.47 
 
 		 2430 aa  95.1  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2667  alpha amylase catalytic region  23.95 
 
 		 853 aa  95.1  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  27.51 
 
 		 676 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.11 
 
 		 588 aa  94.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  26.03 
 
 		 694 aa  94.4  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  27.44 
 
 		 686 aa  94  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  24.24 
 
 		 778 aa  94  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  24.02 
 
 		 739 aa  93.2  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03307  alpha-1,3 glucan synthases (Eurofung)  24.85 
 
 		 2444 aa  92.8  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  26.22 
 
 		 566 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  26.63 
 
 		 676 aa  92  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  26.12 
 
 		 687 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  26.36 
 
 		 676 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  26.36 
 
 		 676 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  26.36 
 
 		 676 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  26.36 
 
 		 676 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  26.36 
 
 		 676 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  24.64 
 
 		 553 aa  90.5  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  25.97 
 
 		 686 aa  89.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  30.22 
 
 		 524 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  22.94 
 
 		 642 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  23.43 
 
 		 878 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  26.36 
 
 		 676 aa  89.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  35.62 
 
 		 528 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  26.36 
 
 		 676 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  27.18 
 
 		 675 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  35 
 
 		 528 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  26.44 
 
 		 675 aa  87.4  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  22.65 
 
 		 762 aa  87.4  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  32.62 
 
 		 576 aa  87.4  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  22.51 
 
 		 583 aa  87  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  35 
 
 		 533 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  27.58 
 
 		 676 aa  87  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  23 
 
 		 878 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 		 258 aa  85.9  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  22.8 
 
 		 878 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  26.82 
 
 		 675 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  23.53 
 
 		 639 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  27.3 
 
 		 675 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  27.3 
 
 		 675 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  31.94 
 
 		 815 aa  85.1  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.33 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  22.97 
 
 		 767 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  23.19 
 
 		 631 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  24.69 
 
 		 641 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  25.66 
 
 		 688 aa  84.3  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  22.57 
 
 		 605 aa  84  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  23.17 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  25.76 
 
 		 687 aa  83.6  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  20.77 
 
 		 619 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  22.71 
 
 		 605 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  22.69 
 
 		 605 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  25.76 
 
 		 687 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  25.76 
 
 		 687 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  21.86 
 
 		 665 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  36.21 
 
 		 575 aa  82  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  25.4 
 
 		 690 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>