More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1514 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 336 aa  633  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  59.8 
 
 		 306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23430  tRNA pseudouridine synthase B  60.36 
 
 		 343 aa  322  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.902891  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  57.1 
 
 		 322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  58.59 
 
 		 310 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  60.46 
 
 		 325 aa  302  5.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  58.78 
 
 		 293 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  57.95 
 
 		 299 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1449  tRNA pseudouridine synthase B  57.59 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00175949  normal  0.371099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  54.79 
 
 		 302 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  55.85 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  55.7 
 
 		 299 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  55.34 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  52.04 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  56.57 
 
 		 298 aa  279  5e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  57.68 
 
 		 289 aa  278  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  56.21 
 
 		 307 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  55.18 
 
 		 295 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  56.38 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1021  tRNA pseudouridine synthase B  53.85 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  54.13 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  51.33 
 
 		 299 aa  269  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  53.16 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  51.19 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  55.56 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  54.79 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  54.79 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  54.79 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1336  tRNA pseudouridine synthase B  59.27 
 
 		 305 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671374  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7739  tRNA pseudouridine synthase B  54.82 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3960  tRNA pseudouridine synthase B  57.54 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1378  tRNA pseudouridine synthase B  57.69 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  49.83 
 
 		 298 aa  249  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  53.9 
 
 		 303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  53.14 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  42.25 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2213  tRNA pseudouridine synthase B  51.42 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0106911  normal  0.0721688 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1745  pseudouridine synthase  40.1 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  40.8 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  41.28 
 
 		 291 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  44.03 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  43.88 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  39.22 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  44.01 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  45.03 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  42.59 
 
 		 313 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  40.62 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  44 
 
 		 297 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  41.75 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  41.86 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  43.06 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  42.71 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  46.15 
 
 		 294 aa  186  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  41.96 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  40.89 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  41.26 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1144  tRNA pseudouridine synthase B  45.1 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431473  normal  0.105946 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  37.29 
 
 		 294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  48.9 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  41.95 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  43.98 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  39.42 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  40.52 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  39.47 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  38.01 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2817  tRNA pseudouridine synthase B  41.49 
 
 		 241 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  hitchhiker  0.00223059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  40.36 
 
 		 311 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  39.92 
 
 		 308 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  47.08 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  43.75 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  43.75 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2203  tRNA pseudouridine synthase B  42.45 
 
 		 302 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.147231  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  34.15 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  46.25 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  41.61 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  49.07 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  34.98 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  41.97 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  41.97 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 		 280 aa  177  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  37.69 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  41.97 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  40.33 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0948  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  41.01 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  41.97 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  41.97 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  41.97 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  41.97 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1165  tRNA pseudouridine synthase B  43.75 
 
 		 313 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  39.15 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  40.3 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  43.21 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  40.14 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  38.84 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  33.8 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  41.83 
 
 		 314 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  33.8 
 
 		 307 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  33.8 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1233  tRNA pseudouridine synthase B  43.4 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0870856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  40.5 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>