More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3345 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  100 
 
 		 281 aa  565  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  47.12 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  45.96 
 
 		 318 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  46.13 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  44.67 
 
 		 311 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  45.26 
 
 		 300 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  47.58 
 
 		 311 aa  241  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  46.39 
 
 		 298 aa  241  9e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  45.45 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  47.16 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  45.96 
 
 		 312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  43.01 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  44.48 
 
 		 328 aa  221  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  45.11 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  44.78 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  42.03 
 
 		 316 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  42.03 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  43.11 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  41.52 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  41.69 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  43.46 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  38.73 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  37.5 
 
 		 290 aa  208  9e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  40.35 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  36.79 
 
 		 289 aa  205  6e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  37.76 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  38.68 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  38.95 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  40.14 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  38.6 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  37.55 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  37.67 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  37.15 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  35.82 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  39.05 
 
 		 290 aa  193  2e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  39.59 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  39.86 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  37.68 
 
 		 286 aa  192  6e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  37.23 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  34.88 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  37.26 
 
 		 283 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  36.21 
 
 		 289 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  36.33 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  41.44 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  36.47 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  38.97 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  38.08 
 
 		 304 aa  185  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  35.86 
 
 		 289 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  39.64 
 
 		 340 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  39.29 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  39.29 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  41.73 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  40.49 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  40.49 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  37.24 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  35.09 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  36.9 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  35.07 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  34.72 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4943  HflC protein  35.76 
 
 		 289 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1880  HflC protein  39.54 
 
 		 299 aa  178  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  36.24 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4891  HflC protein  35.07 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  36.36 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4767  HflC protein  35.07 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  34.97 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  37.45 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1159  HflC protein  38.58 
 
 		 304 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1067  HflC protein  38.2 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2017  HflC protein  38.26 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  38.49 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2248  band 7 protein  38.16 
 
 		 283 aa  175  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  35.56 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  36.92 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  36.43 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  38.36 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3332  band 7 protein  39.5 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0638  HflC protein  35.19 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  34.87 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  35.77 
 
 		 282 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  37.04 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  32.88 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  32.88 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  35.21 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  35.45 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  35.45 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  36.84 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  35.74 
 
 		 293 aa  168  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  35.19 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1941  HflC protein  33.95 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  37.28 
 
 		 321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  36.06 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  37.59 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  37.27 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  35.52 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1432  HflC protein  35.34 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200171  normal  0.890554 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1748  HflC protein  39.13 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  31.25 
 
 		 291 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  36.17 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  34.42 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>