More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2248 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2248  band 7 protein  100 
 
 		 283 aa  568  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2355  band 7 protein  61.07 
 
 		 289 aa  325  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3332  band 7 protein  55.93 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453043  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  37.25 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  36.52 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  38.54 
 
 		 300 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  39.46 
 
 		 318 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  36.59 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  38.57 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  37.92 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  39.46 
 
 		 300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  35.4 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  35.84 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  35.62 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  39.42 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  36.55 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  38.16 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  34.03 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  34.32 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  37.1 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  34.32 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  33.9 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  35.94 
 
 		 295 aa  169  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  39.58 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  35.04 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  36.5 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  35.14 
 
 		 292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  32.21 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  32.45 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  35.55 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  33.82 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  30.93 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  30.27 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  31.4 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  31.46 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  30.85 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  31.52 
 
 		 306 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  33.58 
 
 		 283 aa  148  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  33.22 
 
 		 340 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  33.22 
 
 		 340 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  31.47 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  32.04 
 
 		 304 aa  145  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  30.03 
 
 		 284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  30.3 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  33.33 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  32.55 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  33.33 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  33.69 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  30.41 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  31.69 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  34.83 
 
 		 369 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  34.02 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  32.77 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  31.23 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  30.03 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  30.85 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  33.11 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1748  HflC protein  33.33 
 
 		 328 aa  138  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4939  hflC protein  30.98 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  31.36 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  31.56 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  33 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  32.76 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5670  protease subunit HflC  32.76 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  32.66 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02635  HflC protein  32.4 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  30.2 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  32.87 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  29.25 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0575  hypothetical protein  30.74 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3015  HflC protein  30.64 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.698845  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  30.17 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  29.87 
 
 		 289 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  28.23 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  31.95 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1786  integral membrane proteinase  30.87 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  31.95 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  28.14 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  30.61 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  31.08 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  31.53 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1721  HflC protein  30.87 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  29.05 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  29.05 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1887  hflC protein  27.84 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1562  HflC protein  27.84 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166482 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  28.72 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  30.42 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  29 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  29.41 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  31.62 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2017  HflC protein  30.1 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  27.67 
 
 		 292 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4682  HflC protein  32.14 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  33.2 
 
 		 301 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0867  HflC protein  31.38 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00264104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0526  hypothetical protein  31.35 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  28.19 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  28.72 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  33.33 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>