More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3332 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3332  band 7 protein  100 
 
 		 283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2355  band 7 protein  60.08 
 
 		 289 aa  338  7e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2248  band 7 protein  54.68 
 
 		 283 aa  309  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  42.96 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  41.64 
 
 		 318 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  37.28 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1051  hflC protein  36.24 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3351  HflC protein  40.27 
 
 		 311 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  0.149829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4004  HflC protein  39.31 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  37.5 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2727  HflC protein  40.07 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2348  hypothetical protein  40.94 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  38.97 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2459  HflC protein  35.86 
 
 		 290 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3345  HflC protein  39.5 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6096  protease activity modulator HflK  38.41 
 
 		 311 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2657  HflC protein  35.29 
 
 		 316 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.267381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2884  HflC protein  35.29 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  38.89 
 
 		 295 aa  179  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  34.26 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0605  HflC protein  38.55 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0249897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1955  HflC protein  37.11 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.905613  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_002978  WD0832  hflC protein  34.91 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.379816  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2202  hypothetical protein  37.97 
 
 		 293 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1088  HflC protein  33.99 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2977  hypothetical protein  31.27 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0702  HflC protein  34.43 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2735  protein hflC  35.81 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0491808  normal  0.0307139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2023  HflC protein  34.13 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal  0.555139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3385  HflC protein  33.46 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3382  HflC protein  32.75 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0487  HflC protein  30.58 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.426626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1574  HflC protein  33.59 
 
 		 300 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000132487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  33.33 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2675  HflC protein  29.55 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0356  HflC protein  34.59 
 
 		 340 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.534146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2000  HflC protein  34.59 
 
 		 340 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.491743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0886  HflC protein  34.25 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340526 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1586  HflC protein  33.09 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.258127  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0601  HflC protein  32.32 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974479  hitchhiker  0.00702769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3429  HflC protein  32.32 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00841397  normal  0.0439963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0576  HflC protein  33.56 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  hitchhiker  0.000000000249888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0606  hflC protein  31.99 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0444  HflC protein  30.14 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.653206  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0629  HflC protein  31.75 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2799  HflC protein  32.31 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565333 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  33.22 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2816  HFLC protein  31.1 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.273715  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3172  HflC protein  33.22 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2947  HflC protein  28.87 
 
 		 282 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2587  HflC-like protein  30.88 
 
 		 304 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0635076  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3764  HflC protein  31.86 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000648597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3890  HflC protein  31.86 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0604  hypothetical protein  31.51 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.256149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2540  HflC protein  32.98 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713322  normal  0.756997 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3707  HflC protein  31.86 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0561  HflC protein  31.86 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000351984  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0600  HflC protein  31 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00172359  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2860  HflC protein  29.69 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0800  HflC protein  31.19 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3277  HflC protein  33.33 
 
 		 297 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000125944  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3671  HflC protein  34.91 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0328  HflC protein  33.33 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.791365  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2280  HflC protein  28.97 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0663  HflC protein  32.43 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0721748  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  28.97 
 
 		 281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  30.24 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2017  HflC protein  32.31 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0264  HflC protein  28.57 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0998  HflC protein  30 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1108  HflC protein  30 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3022  hflC protein  31.99 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000029647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1320  HflC protein  28.12 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.422043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3202  HflC protein  30.51 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11004  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3537  HflC protein  30.51 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000127879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1178  HflC protein  32.19 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  30.95 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  29.66 
 
 		 303 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0569  HflC protein  28.38 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254764  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  30.34 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2629  HflC protein  29.21 
 
 		 293 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000539146 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  28.42 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1098  HflC protein  32.52 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3981  HflC protein  29.87 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.515796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07570  membrane bound protease regulator HflC  32.97 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0002  HflC protein  29.2 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1223  putative serine protease transmembrane protein  29.25 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00070103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00652  Membrane protease, stomatin/prohibitin family protein  30.13 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1988  putative serine protease transmembrane protein  30.61 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0922969  normal  0.083656 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  32.3 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5011  HflC protein  33.21 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  32.3 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2600  HflC protein  31.8 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.617958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4167  HflC protein  30.14 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000744211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1283  HflC protein  29.49 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.368114  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0674  HflC protein  30.34 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  31.34 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2766  HflC protein  28.37 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.147962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65270  protease subunit HflC  32.18 
 
 		 289 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2299  HflC protein  31.4 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>