More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8893 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 272 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  54.04 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  40.6 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  34.89 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  42.07 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 271 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 222 aa  99  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 233 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  32.55 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 241 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 218 aa  93.6  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.44 
 
 		 224 aa  92  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  35.91 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 238 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  33.04 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.81 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  30.74 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  32.92 
 
 		 250 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  30.57 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  32.32 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  29.15 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  47.56 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 267 aa  72  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  33.65 
 
 		 228 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  29.06 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  29.76 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>