96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6741 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6741  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
1478 aa  2933    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.692029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  42.39 
 
 
581 aa  68.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
639 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.02 
 
 
626 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
614 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
927 aa  58.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 
626 aa  57.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.7 
 
 
614 aa  57.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
935 aa  57.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.7 
 
 
614 aa  57.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 
614 aa  57.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
614 aa  56.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
4079 aa  56.2  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 
636 aa  56.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
573 aa  56.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
611 aa  55.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  28.72 
 
 
1013 aa  55.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 
637 aa  55.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.83 
 
 
733 aa  55.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
563 aa  55.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
635 aa  55.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  26.58 
 
 
340 aa  55.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
635 aa  55.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.36 
 
 
626 aa  54.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 
612 aa  54.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
795 aa  53.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  24.55 
 
 
314 aa  52.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
596 aa  52.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
804 aa  52  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
4489 aa  52  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
593 aa  51.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
543 aa  51.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
615 aa  51.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
3145 aa  51.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
249 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.18 
 
 
884 aa  51.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1088  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  34.68 
 
 
275 aa  51.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.756407  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
249 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
255 aa  51.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  21.55 
 
 
1979 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.47 
 
 
795 aa  51.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
968 aa  50.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.92 
 
 
887 aa  51.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1168  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  34.68 
 
 
275 aa  51.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.07 
 
 
622 aa  50.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 
366 aa  51.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
441 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 
323 aa  50.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.3 
 
 
441 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.27 
 
 
810 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  27.13 
 
 
936 aa  49.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
377 aa  49.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
1406 aa  49.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
808 aa  49.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
363 aa  49.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  23.29 
 
 
545 aa  48.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
878 aa  48.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  27.51 
 
 
252 aa  48.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.34 
 
 
836 aa  48.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
466 aa  48.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
362 aa  48.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
249 aa  48.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  23.13 
 
 
743 aa  48.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 
361 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
502 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.29 
 
 
415 aa  47  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
280 aa  47.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.51 
 
 
632 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
448 aa  47.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
879 aa  47.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
685 aa  47  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
542 aa  47.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.68 
 
 
725 aa  47.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
522 aa  47.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
1421 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 
766 aa  46.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.57 
 
 
330 aa  47  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 
522 aa  47  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
587 aa  47  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
847 aa  46.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
465 aa  46.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0685  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
438 aa  46.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.80167  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  29.84 
 
 
436 aa  46.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.67 
 
 
602 aa  46.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.31 
 
 
296 aa  45.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 
291 aa  45.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
505 aa  45.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
466 aa  45.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
436 aa  45.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  23.32 
 
 
587 aa  45.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 
207 aa  45.1  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  19.51 
 
 
820 aa  45.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
592 aa  45.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0009  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
267 aa  45.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
1127 aa  45.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.27 
 
 
397 aa  45.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>