More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0819 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  48.39 
 
 		 684 aa  655    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1909  hypothetical protein  51.66 
 
 		 692 aa  700    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00515667  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 695 aa  1373    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1480  hypothetical protein  48.46 
 
 		 701 aa  671    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0156637  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1709  hypothetical protein  32.51 
 
 		 688 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  35.44 
 
 		 685 aa  343  5e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2396  hypothetical protein  29.98 
 
 		 724 aa  300  7e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.92908 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0159  hypothetical protein  27.65 
 
 		 706 aa  293  6e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.33 
 
 		 764 aa  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  23.02 
 
 		 753 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  23.24 
 
 		 829 aa  89  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  23.24 
 
 		 829 aa  89  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  22.58 
 
 		 737 aa  87.4  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  24.47 
 
 		 981 aa  85.9  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  23.13 
 
 		 974 aa  85.5  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  24.26 
 
 		 385 aa  83.2  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  23.62 
 
 		 974 aa  82.8  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  23.62 
 
 		 730 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.9 
 
 		 746 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.98 
 
 		 758 aa  81.6  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  24.63 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  21.41 
 
 		 964 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  23.9 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  22.87 
 
 		 713 aa  79.7  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  20.83 
 
 		 704 aa  79.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  33.77 
 
 		 380 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  23.8 
 
 		 1359 aa  79.7  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  22.48 
 
 		 699 aa  79  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  22.99 
 
 		 893 aa  77  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  22.51 
 
 		 699 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  28.2 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  22.91 
 
 		 864 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  22.88 
 
 		 1146 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  21.15 
 
 		 745 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  22.64 
 
 		 748 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  20.18 
 
 		 717 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  20.82 
 
 		 723 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  23.05 
 
 		 576 aa  71.2  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  25.23 
 
 		 674 aa  70.5  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  25.15 
 
 		 674 aa  70.5  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  22.65 
 
 		 968 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  24.15 
 
 		 712 aa  70.1  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  22.75 
 
 		 967 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  24.26 
 
 		 1013 aa  69.7  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  21.11 
 
 		 758 aa  69.3  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  21.4 
 
 		 752 aa  69.7  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  22.46 
 
 		 701 aa  68.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.98 
 
 		 756 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  22.71 
 
 		 723 aa  68.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  22.48 
 
 		 747 aa  68.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  20.24 
 
 		 1155 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  20.78 
 
 		 731 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.57 
 
 		 812 aa  68.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  23.74 
 
 		 1022 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  24.53 
 
 		 740 aa  68.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  23.74 
 
 		 1022 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  21.25 
 
 		 1204 aa  67.8  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  20.64 
 
 		 682 aa  67.4  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  23.05 
 
 		 707 aa  67.4  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  22.84 
 
 		 747 aa  67.4  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  22.88 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  22.22 
 
 		 709 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  23.11 
 
 		 955 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  20.6 
 
 		 895 aa  66.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  19.38 
 
 		 882 aa  66.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  25.81 
 
 		 1109 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  23.11 
 
 		 955 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  23.11 
 
 		 955 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  20.75 
 
 		 1000 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  30.3 
 
 		 832 aa  65.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  24.23 
 
 		 1077 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  24.15 
 
 		 1062 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  22.54 
 
 		 775 aa  65.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  24.15 
 
 		 1062 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  28.22 
 
 		 923 aa  65.1  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  25.81 
 
 		 1109 aa  65.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  25.71 
 
 		 1089 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  21.15 
 
 		 752 aa  65.1  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.42 
 
 		 1172 aa  64.3  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.06 
 
 		 861 aa  64.3  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  21.85 
 
 		 777 aa  64.3  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  19.42 
 
 		 963 aa  64.3  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  21.67 
 
 		 777 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  20.64 
 
 		 779 aa  63.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  23.67 
 
 		 898 aa  62.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  22.12 
 
 		 968 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  22.12 
 
 		 968 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  22.12 
 
 		 968 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  21.43 
 
 		 741 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  25.1 
 
 		 1068 aa  62.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  20.45 
 
 		 710 aa  62.4  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  22.03 
 
 		 968 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  21.12 
 
 		 959 aa  62  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  21.23 
 
 		 780 aa  61.6  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  22.07 
 
 		 738 aa  61.2  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  20.16 
 
 		 732 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  25.15 
 
 		 699 aa  61.2  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  21.11 
 
 		 730 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  22.3 
 
 		 1049 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.86 
 
 		 886 aa  61.2  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>