More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0330 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  100 
 
 		 479 aa  938    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  34.89 
 
 		 463 aa  309  6.999999999999999e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  34.67 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  34.8 
 
 		 453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  36.3 
 
 		 445 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  34.97 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  32.82 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  35.24 
 
 		 445 aa  259  6e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  34.15 
 
 		 460 aa  249  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 458 aa  239  9e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  30.46 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  32.1 
 
 		 458 aa  231  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  30.16 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  30.47 
 
 		 455 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  29.18 
 
 		 461 aa  217  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  31.39 
 
 		 461 aa  213  5.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  28.79 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  30.31 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  31.3 
 
 		 458 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  30.24 
 
 		 460 aa  203  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  27.6 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  29.42 
 
 		 463 aa  160  6e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 454 aa  154  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  25.66 
 
 		 444 aa  116  8.999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 500 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 450 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 457 aa  114  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.95 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 464 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 456 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  25.28 
 
 		 464 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  25.29 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  27.53 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  25.17 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 464 aa  107  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 450 aa  106  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.7 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 500 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  26.08 
 
 		 440 aa  103  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.69 
 
 		 458 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  22.37 
 
 		 485 aa  100  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  25.59 
 
 		 451 aa  99.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  20.86 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 486 aa  99.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  24.52 
 
 		 455 aa  99  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 475 aa  99  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.14 
 
 		 455 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  28 
 
 		 454 aa  99  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  25.31 
 
 		 453 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  25.31 
 
 		 453 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 452 aa  98.2  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  25.31 
 
 		 453 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  21.17 
 
 		 459 aa  97.8  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  24.82 
 
 		 454 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  25.31 
 
 		 453 aa  97.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  25.17 
 
 		 452 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 518 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  22.05 
 
 		 483 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  24.51 
 
 		 452 aa  95.9  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 481 aa  95.9  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  22.9 
 
 		 450 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.31 
 
 		 462 aa  95.1  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 448 aa  94  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 486 aa  94  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  23 
 
 		 525 aa  94  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 453 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 490 aa  93.2  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  23.73 
 
 		 445 aa  93.2  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  24.94 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  25.61 
 
 		 452 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  24.05 
 
 		 504 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 481 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  22.29 
 
 		 468 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.24 
 
 		 495 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>