More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6668 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6668  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 576 aa  1170    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  79.32 
 
 		 577 aa  911    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1311  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.09 
 
 		 570 aa  595  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4733  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.48 
 
 		 568 aa  589  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4787  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.37 
 
 		 573 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.824401  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6576  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.85 
 
 		 583 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.298955 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.78 
 
 		 564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.833385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6155  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.96 
 
 		 559 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1504  putative choline dehydrogenase  43.97 
 
 		 591 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228546  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4242  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.7 
 
 		 549 aa  361  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.43 
 
 		 515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1582  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.14 
 
 		 533 aa  253  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.33 
 
 		 549 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.95 
 
 		 534 aa  246  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.69 
 
 		 536 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0056  GMC family oxidoreductase  34.39 
 
 		 550 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000620913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.39 
 
 		 548 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.010293  normal  0.0125106 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.11 
 
 		 539 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4076  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.4 
 
 		 516 aa  237  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00359507  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.39 
 
 		 541 aa  237  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.39 
 
 		 548 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000289824 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  31.59 
 
 		 562 aa  236  9e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  32.89 
 
 		 553 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  30.48 
 
 		 552 aa  233  7.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6326  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.26 
 
 		 554 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1098  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.28 
 
 		 529 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.18 
 
 		 542 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.5 
 
 		 518 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1846  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.15 
 
 		 547 aa  230  7e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  32.13 
 
 		 559 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.66 
 
 		 540 aa  229  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 		 559 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  31.24 
 
 		 560 aa  227  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0075  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.39 
 
 		 548 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0217236  hitchhiker  0.000000000166725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  33.39 
 
 		 570 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.88 
 
 		 563 aa  227  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  33.67 
 
 		 551 aa  227  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4749  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  31.56 
 
 		 546 aa  226  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769541  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1739  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.79 
 
 		 541 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.5 
 
 		 556 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.42 
 
 		 537 aa  226  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  31.65 
 
 		 565 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.94 
 
 		 543 aa  225  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1614  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  31.33 
 
 		 547 aa  224  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  33.73 
 
 		 1290 aa  224  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.37 
 
 		 546 aa  224  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1543  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.04 
 
 		 530 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.92 
 
 		 535 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0194  GMC family oxidoreductase  33.28 
 
 		 548 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6705  choline dehydrogenase  32.78 
 
 		 516 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.44 
 
 		 552 aa  223  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  32.04 
 
 		 551 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3506  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.41 
 
 		 575 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145411  normal  0.0815254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  30 
 
 		 556 aa  223  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  30.82 
 
 		 559 aa  223  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5337  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.65 
 
 		 600 aa  223  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.231686 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1487  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.35 
 
 		 551 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  30.51 
 
 		 564 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1507  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.22 
 
 		 548 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.23617  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.11 
 
 		 556 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.09 
 
 		 509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.09 
 
 		 532 aa  220  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4528  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33 
 
 		 550 aa  220  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1035  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.53 
 
 		 609 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3358  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.17 
 
 		 550 aa  220  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  31.47 
 
 		 560 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3579  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.52 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000745521  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.93 
 
 		 530 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  30.58 
 
 		 561 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  30.41 
 
 		 565 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2223  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.53 
 
 		 531 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.487572  normal  0.417914 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0054  GMC oxidoreductase  32.13 
 
 		 556 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810146  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  30.58 
 
 		 561 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4867  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.81 
 
 		 560 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  30.58 
 
 		 561 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  30.58 
 
 		 561 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0061  GMC oxidoreductase  32.29 
 
 		 556 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0062  GMC oxidoreductase  32.29 
 
 		 556 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.61 
 
 		 542 aa  218  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.81 
 
 		 576 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0278  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein  32.29 
 
 		 556 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  30.82 
 
 		 550 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.47 
 
 		 576 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1383  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.66 
 
 		 551 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00471975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.22 
 
 		 560 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2458  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.6 
 
 		 554 aa  218  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.144677  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  30.94 
 
 		 572 aa  217  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.71 
 
 		 536 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4377  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.66 
 
 		 551 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.49 
 
 		 538 aa  216  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37100  putative dehydrogenase  34.11 
 
 		 545 aa  216  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  30.17 
 
 		 574 aa  216  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0698  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.3 
 
 		 551 aa  216  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763915  decreased coverage  0.00316946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.5 
 
 		 550 aa  216  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6221  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.82 
 
 		 551 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000364  choline dehydrogenase  28.71 
 
 		 571 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  30.83 
 
 		 557 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3373  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.34 
 
 		 553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  32.99 
 
 		 562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3919  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.73 
 
 		 572 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>