More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6454 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 386 aa  778    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  73.83 
 
 		 378 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  80.83 
 
 		 381 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  74.22 
 
 		 377 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  71.23 
 
 		 365 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4467  secretion protein HlyD family protein  68.89 
 
 		 361 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0716  secretion protein HlyD family protein  70.34 
 
 		 365 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0750  secretion protein HlyD family protein  70.09 
 
 		 365 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0754  secretion protein HlyD family protein  67.96 
 
 		 365 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  52.25 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  52.25 
 
 		 364 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  52.68 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  36.9 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  39.34 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  36.04 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 		 354 aa  209  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  35.56 
 
 		 354 aa  202  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  33.05 
 
 		 355 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  34.1 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  35.69 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1000  multidrug resistance efflux pump  38.54 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  32.76 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  32.2 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  32.56 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000534  putative secretion protein  35 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  31.71 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4051  HlyD family secretion protein  31.95 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3251  secretion protein HlyD family protein  31.81 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  32.44 
 
 		 352 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  29.23 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3625  secretion protein HlyD  35.28 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.110233  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  31.2 
 
 		 354 aa  156  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0621  secretion protein HlyD family protein  31.05 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.602249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  31.85 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  31.85 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  30.11 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  30.11 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  30.11 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20620  HlyD family secretion protein  33.52 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0045141  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  30.11 
 
 		 352 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  32.49 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1770  putative secretion protein  33.52 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  29.64 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  35.17 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  35.17 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  35.17 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  35.17 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  29.34 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  35.17 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  34.83 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  34.83 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  34.83 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  29.97 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  29.34 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2656  secretion protein HlyD  32.1 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  30.86 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  33.13 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  30.86 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  30.86 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2823  hypothetical protein  32.69 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  32.56 
 
 		 374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  29.59 
 
 		 402 aa  126  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  29.58 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33220  hypothetical protein  31.82 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0256894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  30.56 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  28.81 
 
 		 354 aa  123  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  28.72 
 
 		 444 aa  122  9e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.49 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  32.15 
 
 		 422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  30.17 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  28.21 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  28.21 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  28.21 
 
 		 378 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  29.38 
 
 		 366 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  31.14 
 
 		 371 aa  119  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0470  secretion protein HlyD family protein  22.83 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  30.36 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  28.21 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  32.41 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  29.06 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  31.27 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  28.21 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3975  multidrug resistance protein MdtN  31.46 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.337491  normal  0.0140757 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3904  efflux pump membrane protein  31.76 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  28.89 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  29.21 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  29.27 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  33.23 
 
 		 363 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  27.42 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  30.67 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0195  multidrug resistance protein MdtN  34.31 
 
 		 362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0296812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  33.45 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  29.63 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  27.58 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  28.72 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>