More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20480 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  100 
 
 
835 aa  1605    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  35.18 
 
 
871 aa  295  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  31.65 
 
 
878 aa  293  7e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  36.31 
 
 
855 aa  284  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  33.41 
 
 
859 aa  269  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  37.33 
 
 
846 aa  257  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  29.35 
 
 
880 aa  248  4e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  34.24 
 
 
846 aa  242  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  32.51 
 
 
836 aa  225  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  32.14 
 
 
857 aa  222  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  29.19 
 
 
897 aa  221  5e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  34.57 
 
 
848 aa  214  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  30.18 
 
 
855 aa  208  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  30.31 
 
 
852 aa  205  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  29.57 
 
 
847 aa  201  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  33.06 
 
 
825 aa  198  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  32.09 
 
 
845 aa  194  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  29.99 
 
 
843 aa  193  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  29.87 
 
 
861 aa  191  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  30.3 
 
 
838 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  28.76 
 
 
856 aa  186  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  29.4 
 
 
842 aa  185  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  29.01 
 
 
859 aa  174  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  29.12 
 
 
873 aa  172  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  27.95 
 
 
854 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  30.14 
 
 
839 aa  168  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  28.55 
 
 
841 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  30 
 
 
861 aa  153  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  28.63 
 
 
834 aa  151  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  32.69 
 
 
821 aa  148  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 
853 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26.76 
 
 
855 aa  143  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  31.76 
 
 
866 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  31.33 
 
 
828 aa  141  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  30.45 
 
 
853 aa  140  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  32.29 
 
 
806 aa  137  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.41 
 
 
858 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  30.7 
 
 
930 aa  132  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.1 
 
 
857 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  21.75 
 
 
856 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  30.3 
 
 
849 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  50 
 
 
738 aa  102  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  33.23 
 
 
849 aa  101  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  19.52 
 
 
896 aa  90.1  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  24.83 
 
 
854 aa  87  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  23.95 
 
 
858 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  30.84 
 
 
826 aa  85.5  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  20.87 
 
 
850 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 
873 aa  84.7  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  19.19 
 
 
829 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.57 
 
 
855 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  19.08 
 
 
829 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  32.61 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  27.78 
 
 
794 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  23.46 
 
 
850 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  27.15 
 
 
857 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 
855 aa  77  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  31.89 
 
 
395 aa  76.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
847 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
833 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.27 
 
 
851 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  25.7 
 
 
841 aa  75.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.07 
 
 
863 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  29.13 
 
 
822 aa  73.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  45.98 
 
 
853 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  38.02 
 
 
438 aa  72  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  25.74 
 
 
846 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  35.07 
 
 
452 aa  70.5  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  30.65 
 
 
759 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  26.61 
 
 
828 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  35.82 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.9 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.62 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  32.53 
 
 
857 aa  68.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  24.68 
 
 
870 aa  68.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  23.35 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.52 
 
 
847 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  21 
 
 
835 aa  67.4  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  25.87 
 
 
431 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  25.83 
 
 
852 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  28.2 
 
 
393 aa  66.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.8 
 
 
397 aa  65.9  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  30.77 
 
 
1130 aa  65.5  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 
874 aa  65.1  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.93 
 
 
413 aa  65.1  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  28.96 
 
 
399 aa  63.9  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  29.91 
 
 
409 aa  63.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1517  hypothetical protein  24.3 
 
 
829 aa  64.3  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  26.94 
 
 
387 aa  63.9  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  27.16 
 
 
844 aa  64.3  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.97 
 
 
400 aa  63.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  30.37 
 
 
411 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  25.1 
 
 
444 aa  62.4  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 
1016 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  33.88 
 
 
855 aa  62.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  30.71 
 
 
952 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  30.18 
 
 
423 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  30.46 
 
 
394 aa  62.4  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  22.92 
 
 
849 aa  61.6  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  23.71 
 
 
850 aa  61.6  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>