More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7201 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  76.73 
 
 
690 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  100 
 
 
652 aa  1282    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  77.15 
 
 
679 aa  702    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  92.76 
 
 
646 aa  926    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  75.76 
 
 
690 aa  717    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  92.95 
 
 
642 aa  927    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  92.95 
 
 
642 aa  927    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  76.83 
 
 
690 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  88.89 
 
 
656 aa  870    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  87.36 
 
 
657 aa  863    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  66.07 
 
 
620 aa  633  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  59.77 
 
 
663 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  54.89 
 
 
633 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  56.09 
 
 
603 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  57.25 
 
 
634 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  52.77 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  53.42 
 
 
595 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  47.76 
 
 
514 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  47.95 
 
 
504 aa  339  9e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  43.31 
 
 
574 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  38.12 
 
 
571 aa  320  5e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  39.36 
 
 
482 aa  300  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  39.95 
 
 
482 aa  276  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  38.41 
 
 
484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  35.68 
 
 
493 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  34.44 
 
 
478 aa  250  6e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  34.3 
 
 
461 aa  248  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  35.78 
 
 
483 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  33.91 
 
 
486 aa  240  5.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  34.3 
 
 
491 aa  234  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  36.31 
 
 
507 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  36.36 
 
 
455 aa  231  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  34.47 
 
 
461 aa  230  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  34.01 
 
 
461 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  34.01 
 
 
461 aa  227  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  34.57 
 
 
539 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  34.13 
 
 
517 aa  224  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  36.32 
 
 
486 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0800  type II and III secretion system protein  34.67 
 
 
510 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  36.39 
 
 
497 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  33.99 
 
 
493 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  34.29 
 
 
493 aa  220  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  35.23 
 
 
501 aa  219  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  34.26 
 
 
466 aa  218  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  34.66 
 
 
492 aa  218  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  34.54 
 
 
460 aa  217  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  34.19 
 
 
497 aa  216  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  33.74 
 
 
479 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  34.15 
 
 
487 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  35.32 
 
 
473 aa  214  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 
460 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  33.96 
 
 
499 aa  211  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  33.64 
 
 
474 aa  210  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  37.28 
 
 
479 aa  210  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  33.02 
 
 
460 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 
466 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  33.97 
 
 
480 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  33.41 
 
 
491 aa  208  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  34.26 
 
 
502 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  30.63 
 
 
490 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  34.17 
 
 
502 aa  205  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 
480 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  34.77 
 
 
495 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  32.6 
 
 
482 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  32.6 
 
 
482 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  32.6 
 
 
482 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  32 
 
 
492 aa  204  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  32.6 
 
 
482 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  32.6 
 
 
482 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  32.6 
 
 
482 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  35.66 
 
 
461 aa  204  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  33.18 
 
 
489 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  34.76 
 
 
464 aa  200  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  30.72 
 
 
524 aa  200  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  34.69 
 
 
494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3997  type II and III secretion system protein  33.04 
 
 
516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  32.54 
 
 
525 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  30.93 
 
 
477 aa  194  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  33.65 
 
 
494 aa  193  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  33.49 
 
 
496 aa  193  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  33.63 
 
 
530 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0723  type II and III secretion system protein  31.73 
 
 
507 aa  191  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0315649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 
546 aa  191  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  28.99 
 
 
512 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  34.9 
 
 
473 aa  188  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  31.58 
 
 
526 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  32.7 
 
 
491 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  31.37 
 
 
499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  31.29 
 
 
499 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  31.67 
 
 
484 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  31.67 
 
 
487 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  31.71 
 
 
451 aa  178  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  31.32 
 
 
622 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  30.31 
 
 
451 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  39.29 
 
 
457 aa  171  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  35.86 
 
 
468 aa  170  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  36.65 
 
 
454 aa  170  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  40.08 
 
 
469 aa  169  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  36.49 
 
 
441 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  36.49 
 
 
441 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>