More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3587 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 
408 aa  806    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.31 
 
 
453 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.67 
 
 
445 aa  255  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  35.15 
 
 
441 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.21 
 
 
432 aa  232  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.74 
 
 
492 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.45 
 
 
438 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.07 
 
 
447 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  34.31 
 
 
441 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.71 
 
 
480 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.07 
 
 
441 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.5 
 
 
479 aa  216  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.82 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  32.34 
 
 
661 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.36 
 
 
446 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.98 
 
 
481 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.36 
 
 
446 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4335  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.25 
 
 
443 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526899  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.63 
 
 
446 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.09 
 
 
440 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.99 
 
 
420 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.01 
 
 
505 aa  206  6e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.42 
 
 
471 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  30.98 
 
 
436 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.61 
 
 
505 aa  202  7e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  31.96 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.4 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.87 
 
 
455 aa  200  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.66 
 
 
433 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.44 
 
 
417 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.44 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  32.84 
 
 
433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  32.27 
 
 
446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.46 
 
 
449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.05 
 
 
431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.84 
 
 
433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  28.92 
 
 
427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.41 
 
 
449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.76 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.98 
 
 
444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.27 
 
 
435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.19 
 
 
437 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.18 
 
 
449 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  29.23 
 
 
462 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.04 
 
 
447 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  35.63 
 
 
443 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.82 
 
 
462 aa  192  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.17 
 
 
473 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.42 
 
 
446 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.51 
 
 
477 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.84 
 
 
454 aa  190  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.37 
 
 
471 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  31.53 
 
 
432 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  35.38 
 
 
443 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.64 
 
 
440 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.33 
 
 
440 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.98 
 
 
445 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  30.75 
 
 
432 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30 
 
 
442 aa  187  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.44 
 
 
494 aa  186  5e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  30.86 
 
 
447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.8 
 
 
456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.07 
 
 
433 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.94 
 
 
448 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.94 
 
 
448 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.5 
 
 
437 aa  180  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.93 
 
 
443 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  30.55 
 
 
446 aa  179  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.94 
 
 
455 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.5 
 
 
442 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29 
 
 
448 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  30.27 
 
 
446 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.23 
 
 
453 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  28.5 
 
 
442 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  28.5 
 
 
442 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.42 
 
 
452 aa  176  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.55 
 
 
442 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.5 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.37 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.33 
 
 
453 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  29.83 
 
 
435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.81 
 
 
451 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0064  putative type I secretion protein, HlyD family  27.86 
 
 
429 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.39 
 
 
435 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1665  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.68 
 
 
448 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1982  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.68 
 
 
448 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.07 
 
 
454 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.08 
 
 
453 aa  170  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.05 
 
 
446 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.9 
 
 
458 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.75 
 
 
428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.83 
 
 
455 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.29 
 
 
457 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.07 
 
 
487 aa  161  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.36 
 
 
451 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.94 
 
 
439 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.05 
 
 
460 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.3 
 
 
458 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.41 
 
 
436 aa  160  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.848242  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>