More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1428 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  88.02 
 
 		 195 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  88.02 
 
 		 195 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  88.02 
 
 		 195 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  88.02 
 
 		 195 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  87.5 
 
 		 195 aa  318  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  87.5 
 
 		 195 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  87.5 
 
 		 195 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  68.95 
 
 		 194 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  65.76 
 
 		 199 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  65.93 
 
 		 219 aa  231  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 206 aa  230  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  64.84 
 
 		 221 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  66.48 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  61.88 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  60.11 
 
 		 209 aa  211  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  56.28 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  56.04 
 
 		 193 aa  187  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  57.23 
 
 		 193 aa  170  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  43.89 
 
 		 188 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 189 aa  157  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.11 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  45.81 
 
 		 194 aa  150  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 197 aa  148  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  42.94 
 
 		 194 aa  141  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 189 aa  140  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  41.44 
 
 		 189 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  44.2 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  44.26 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  43.17 
 
 		 183 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  40.44 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  36.46 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  35.91 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 190 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  32.6 
 
 		 189 aa  104  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  32.78 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  34.27 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  27.49 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  27.68 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  24.26 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  28.49 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  30 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  24.18 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  26.14 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  27.12 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1604  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  24.18 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  30.06 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  29.44 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  26.59 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  24.19 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  29.78 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  28.22 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  32.18 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  23.89 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  23.89 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  23.89 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  23.89 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>