More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0140 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 182 aa  362  1e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  61.01 
 
 		 169 aa  177  4.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 212 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  40.68 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 272 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  43.28 
 
 		 213 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  40.76 
 
 		 230 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  41.06 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  46.81 
 
 		 227 aa  95.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 243 aa  92  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 230 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 230 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 195 aa  90.1  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  35.88 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  41.91 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  34.83 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  34.76 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  33.13 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1083  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  31.74 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  36.88 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  35.52 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 143 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  38.61 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  32.85 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 291 aa  71.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  33.15 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  32.37 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  27.49 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  32.96 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  30.59 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  28 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  36.25 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  34.82 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  26.71 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  42.96 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  28.92 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  28.92 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  34.92 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  28.92 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  29.27 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  29.45 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  36.3 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  27.78 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  26.67 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  31.28 
 
 		 232 aa  64.3  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  37.38 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  30.34 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  29.88 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  30.34 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  28.97 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  30.34 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  29.25 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  33.54 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  34.51 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  26.62 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  29.73 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  29.56 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  28.74 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  28.14 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  32.54 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  35.21 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>