180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17390 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 140 aa  281  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  45.19 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  42.73 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  41.82 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  43.93 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  43.93 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  38.64 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  43.42 
 
 		 183 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  32.37 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  36.19 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  32.35 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  38.55 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  33.61 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  31.19 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  34.41 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  38.67 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  43.28 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  43.28 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  43.28 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  31.03 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  36.45 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  36.56 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  28.24 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  31.15 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  28.24 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  35.29 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  39.19 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  30.3 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  33 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  39.33 
 
 		 304 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  30.53 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  38.64 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  29.01 
 
 		 185 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  29.67 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  28.44 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  27.21 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  27.06 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  35.96 
 
 		 319 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  27.46 
 
 		 174 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  34.41 
 
 		 193 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 184 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  36.67 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  29.51 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  29.63 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  34.83 
 
 		 295 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  30.25 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  36.27 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  29.55 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  38.36 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  38.96 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  27.27 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  31 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  28.1 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  33.75 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  26.21 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  27.08 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  33.72 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  33.75 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  35.63 
 
 		 329 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  32.09 
 
 		 301 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  36.08 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  31.08 
 
 		 225 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  25 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  34.52 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  32.56 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  34.85 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  24.3 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2042  hypothetical protein  33.63 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>