142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7332 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7332  Transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 354 aa  707    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4714  putative transcriptional regulator protein, ROK family  34.02 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4697  putative transcriptional regulator protein, ROK family  34.02 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.925334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  26.63 
 
 		 418 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.31 
 
 		 417 aa  90.1  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  25.72 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  24.93 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  24.66 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  24.41 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  26.67 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  23.94 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  23.62 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  25.43 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  24.86 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  25.91 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  25.84 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  25.95 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  26.56 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  22.51 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  22.57 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  21.23 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  23.51 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  26.02 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  21.46 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  26.8 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.33 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  23.97 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  23.89 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  22.67 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  23.39 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  23.42 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  22.22 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  22.22 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0891  ROK family protein  24.29 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  26.14 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  23.67 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  23.23 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  22.92 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  22.92 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  26.97 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  23.99 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  23.08 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  25 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0913  ROK family protein  23.14 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  22.92 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  23.69 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  23.1 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  22.54 
 
 		 415 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  22.54 
 
 		 415 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  22.54 
 
 		 415 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  22.59 
 
 		 405 aa  52.8  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  23.04 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  21.97 
 
 		 415 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  22.29 
 
 		 434 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_2190  ROK family protein  23.79 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  21.97 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  22.48 
 
 		 416 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  21.97 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4939  ROK family protein  26.78 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  22.84 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  21.98 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  19.75 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  20.52 
 
 		 410 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  21.35 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  22.83 
 
 		 374 aa  49.7  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  22.33 
 
 		 374 aa  49.3  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  22.85 
 
 		 411 aa  49.3  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  21.99 
 
 		 387 aa  49.3  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  23.81 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  22.54 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  25.44 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  21.98 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  19.7 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  22.8 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  21.76 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  20.36 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  26.11 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  27.88 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  28.63 
 
 		 473 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  22.84 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  22.32 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  22.41 
 
 		 413 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  20.8 
 
 		 421 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1703  NagC family Transcriptional regulator  24.17 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  24.74 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  24.66 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  23.5 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  21.89 
 
 		 408 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  22.32 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  21.89 
 
 		 408 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  21.89 
 
 		 408 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1344  ROK family protein  26.32 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0409693  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  29.07 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  21.47 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
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NC_002976  SERP2517  xylose repressor  21.52 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0778227  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  24.68 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
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