289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4068 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 568 aa  1144    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  74.87 
 
 		 563 aa  835    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0242  flagellar MS-ring protein  71.76 
 
 		 557 aa  790    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.176969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0305  flagellar MS-ring protein  74.69 
 
 		 563 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0286  flagellar MS-ring protein  46.1 
 
 		 545 aa  478  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.722484  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  44.88 
 
 		 553 aa  461  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  42.36 
 
 		 547 aa  435  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  44.66 
 
 		 579 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  43.99 
 
 		 580 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0035  flagellar MS-ring protein  43.5 
 
 		 546 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  43.93 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  42.45 
 
 		 546 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  46.81 
 
 		 544 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  39.19 
 
 		 570 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  45.1 
 
 		 572 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  38.9 
 
 		 559 aa  392  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  38.9 
 
 		 559 aa  392  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  31.23 
 
 		 551 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  31.24 
 
 		 540 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2184  flagellar M-ring protein FliF  31.71 
 
 		 552 aa  214  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  32.39 
 
 		 532 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  31.35 
 
 		 541 aa  213  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  33.55 
 
 		 538 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  32.3 
 
 		 541 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4573  flagellar MS-ring protein  30.95 
 
 		 538 aa  200  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.628076  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  31.18 
 
 		 520 aa  200  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  31.18 
 
 		 535 aa  200  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4092  flagellar MS-ring protein  30.49 
 
 		 540 aa  198  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4460  flagellar MS-ring protein  30.49 
 
 		 540 aa  198  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.2943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5126  flagellar MS-ring protein  31.21 
 
 		 539 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0640822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3846  flagellar MS-ring protein  32.63 
 
 		 532 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 		 543 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3458  flagellar MS-ring protein  30.77 
 
 		 547 aa  187  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  0.0942955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  32.84 
 
 		 587 aa  187  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  29.53 
 
 		 539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  30.39 
 
 		 528 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  30.17 
 
 		 595 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  31.24 
 
 		 527 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2972  flagellar MS-ring protein  29.39 
 
 		 542 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  29.05 
 
 		 561 aa  184  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1312  flagellar MS-ring protein  29.39 
 
 		 509 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0364149  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  30.66 
 
 		 593 aa  183  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  31.22 
 
 		 525 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0941  flagellar MS-ring protein  30.94 
 
 		 539 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  33.25 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  33.25 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  33.25 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  31.56 
 
 		 551 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  34.21 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2947  flagellar MS-ring protein  29.71 
 
 		 571 aa  180  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.532246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  30.18 
 
 		 525 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  29.89 
 
 		 600 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  33.42 
 
 		 587 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  33.42 
 
 		 598 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  33.42 
 
 		 598 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  30.37 
 
 		 527 aa  177  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  33.42 
 
 		 598 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  33.42 
 
 		 587 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  32.05 
 
 		 677 aa  177  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  31.44 
 
 		 603 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  29.86 
 
 		 533 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  32.01 
 
 		 530 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  32.9 
 
 		 598 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4180  flagellar MS-ring protein  33.57 
 
 		 583 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  32.9 
 
 		 598 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  32.9 
 
 		 598 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  32.9 
 
 		 598 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  29.64 
 
 		 562 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  31.14 
 
 		 539 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  30.8 
 
 		 571 aa  170  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  28.51 
 
 		 590 aa  170  8e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  32.4 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  29.62 
 
 		 538 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  33.02 
 
 		 519 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  31.93 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  31.79 
 
 		 523 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  29.44 
 
 		 580 aa  167  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  30.79 
 
 		 564 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  30.79 
 
 		 564 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  29.4 
 
 		 544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  28.7 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  29.65 
 
 		 544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  29.3 
 
 		 584 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  29.7 
 
 		 567 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  32.94 
 
 		 530 aa  163  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  26.94 
 
 		 597 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  28.72 
 
 		 566 aa  163  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  27.93 
 
 		 570 aa  163  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  29.73 
 
 		 567 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0686  flagellar MS-ring protein  27.35 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.54488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  30.34 
 
 		 566 aa  162  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  29.74 
 
 		 611 aa  161  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  28.71 
 
 		 547 aa  161  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  28.18 
 
 		 529 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  29.55 
 
 		 500 aa  160  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  30.3 
 
 		 611 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.07 
 
 		 579 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  30.3 
 
 		 611 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0038  flagellar M-ring protein FliF  31.4 
 
 		 505 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.796687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2649  flagellar MS-ring protein  27.67 
 
 		 526 aa  160  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>