More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1636 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  100 
 
 		 342 aa  695    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  64.91 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 357 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  31.25 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 371 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  30.06 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  30.54 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 334 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 353 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 406 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  36.71 
 
 		 344 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 1654 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 362 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.84 
 
 		 348 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.31 
 
 		 744 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  38.52 
 
 		 1008 aa  106  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 532 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 465 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 354 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 360 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 603 aa  105  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  39.86 
 
 		 971 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.16 
 
 		 1239 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1714 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 1560 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 461 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 362 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  26.34 
 
 		 1399 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2265  signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.887672  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 572 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 		 872 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  32.49 
 
 		 387 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 545 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 681 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 488 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 1093 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.34 
 
 		 783 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 597 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 834 aa  99.8  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 1093 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0693  Signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 400 aa  99.4  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 439 aa  99.4  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 382 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 215 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 2693 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25 
 
 		 1407 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 764 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 		 3706 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 676 aa  96.7  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 398 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 626 aa  96.3  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 381 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 723 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 839 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 1246 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 874 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 392 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 871 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 408 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 492 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 551 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 1676 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 1093 aa  92.8  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 682 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1182 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 936 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 746 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.77 
 
 		 381 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 732 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 771 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 704 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 886 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 1253 aa  90.5  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 381 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 945 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 815 aa  89.4  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>