More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1243 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  43.98 
 
 		 3619 aa  919    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  39.97 
 
 		 2342 aa  878    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  39.78 
 
 		 2342 aa  883    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  100 
 
 		 1625 aa  3294    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  41.78 
 
 		 3608 aa  944    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  41.76 
 
 		 3094 aa  881    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2871  Animal heme peroxidase  52.27 
 
 		 1712 aa  1236    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  42.29 
 
 		 3587 aa  647    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  42.45 
 
 		 3587 aa  648    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  44.05 
 
 		 2950 aa  857    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  42.66 
 
 		 3619 aa  919    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  45.73 
 
 		 1650 aa  972    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3184  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  80.83 
 
 		 1687 aa  330  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  63.64 
 
 		 500 aa  259  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  60.91 
 
 		 1518 aa  259  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3166  Allergen V5/Tpx-1 family protein  62.57 
 
 		 461 aa  252  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3165  Allergen V5/Tpx-1 family protein  59.57 
 
 		 568 aa  242  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.845212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  50.4 
 
 		 637 aa  242  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3169  S-layer domain-containing protein  57.98 
 
 		 533 aa  238  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  60.53 
 
 		 1129 aa  231  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  50 
 
 		 601 aa  187  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  53.44 
 
 		 657 aa  186  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  47.06 
 
 		 617 aa  172  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.78 
 
 		 1795 aa  110  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  41.27 
 
 		 2105 aa  108  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.23 
 
 		 980 aa  103  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  32.05 
 
 		 1534 aa  102  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  34.3 
 
 		 1164 aa  102  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  39.59 
 
 		 491 aa  101  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  37.05 
 
 		 2954 aa  97.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  40.36 
 
 		 744 aa  97.1  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  40.41 
 
 		 946 aa  96.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  41.8 
 
 		 2885 aa  96.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  38.04 
 
 		 260 aa  95.5  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  34.36 
 
 		 589 aa  95.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2936  peroxidase  27.59 
 
 		 714 aa  93.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  35.35 
 
 		 9867 aa  92.8  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  42.86 
 
 		 950 aa  92.8  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.96 
 
 		 1963 aa  92.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  33.22 
 
 		 795 aa  92  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.06 
 
 		 1279 aa  91.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.08 
 
 		 2667 aa  91.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  36.81 
 
 		 709 aa  90.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.62 
 
 		 3427 aa  90.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  31.79 
 
 		 1532 aa  90.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  40.24 
 
 		 243 aa  90.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  40.13 
 
 		 813 aa  90.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  32.37 
 
 		 3954 aa  89.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  37.21 
 
 		 5171 aa  89  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.06 
 
 		 588 aa  89  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  34.24 
 
 		 639 aa  88.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  32.73 
 
 		 833 aa  87.8  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.44 
 
 		 2689 aa  86.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.76 
 
 		 2668 aa  87  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.04 
 
 		 1236 aa  84.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  28.18 
 
 		 769 aa  84.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  37 
 
 		 2145 aa  85.1  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  33.08 
 
 		 1287 aa  84.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  39.02 
 
 		 686 aa  84.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  32.78 
 
 		 1883 aa  84  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1424 aa  84  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  41.08 
 
 		 1363 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  41.46 
 
 		 595 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  36.73 
 
 		 460 aa  83.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  32.9 
 
 		 387 aa  83.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  30.68 
 
 		 4334 aa  82.8  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  38.73 
 
 		 982 aa  82.8  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.87 
 
 		 2775 aa  82.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  39.1 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  31.49 
 
 		 615 aa  81.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  41.79 
 
 		 938 aa  81.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  33.96 
 
 		 757 aa  80.5  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  34.31 
 
 		 724 aa  80.1  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  35.9 
 
 		 526 aa  79.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  40.62 
 
 		 613 aa  79.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  38.51 
 
 		 232 aa  79.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  38.67 
 
 		 686 aa  79.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  35.98 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  35.98 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  39.39 
 
 		 680 aa  79  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  33.2 
 
 		 4687 aa  78.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  36.23 
 
 		 341 aa  78.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 202 aa  77  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  35.26 
 
 		 421 aa  77  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  40 
 
 		 202 aa  77  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  39.47 
 
 		 1175 aa  77  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  32.55 
 
 		 728 aa  76.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  35.68 
 
 		 1895 aa  76.3  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.51 
 
 		 2678 aa  75.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  44.95 
 
 		 679 aa  76.3  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  37.04 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  37.13 
 
 		 257 aa  75.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  35.87 
 
 		 437 aa  74.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  35.45 
 
 		 361 aa  75.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  36.9 
 
 		 606 aa  75.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  31.84 
 
 		 1043 aa  73.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  36.48 
 
 		 219 aa  73.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  34.78 
 
 		 867 aa  73.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.32 
 
 		 1016 aa  74.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  29.89 
 
 		 1400 aa  73.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>