183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1541 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  100 
 
 
414 aa  834    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  41.35 
 
 
532 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  35.09 
 
 
597 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
549 aa  113  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  34.65 
 
 
578 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  34.65 
 
 
601 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  33.45 
 
 
662 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  30.77 
 
 
578 aa  110  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  34.29 
 
 
564 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  33.33 
 
 
551 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  30.99 
 
 
558 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  33.08 
 
 
552 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  31.93 
 
 
520 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  29.79 
 
 
576 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  31.37 
 
 
569 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  29.41 
 
 
584 aa  99.8  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  28.78 
 
 
506 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  29.18 
 
 
565 aa  92.8  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  29.18 
 
 
537 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  31.32 
 
 
564 aa  90.1  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  29.86 
 
 
515 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  32.73 
 
 
549 aa  87.4  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  29.58 
 
 
522 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  33.33 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.47 
 
 
415 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  29.03 
 
 
562 aa  84.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  27.34 
 
 
539 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  28.88 
 
 
548 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.82 
 
 
542 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.82 
 
 
542 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.82 
 
 
542 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  33.71 
 
 
484 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  33.71 
 
 
484 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  26.59 
 
 
606 aa  75.5  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  28.4 
 
 
554 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  26.59 
 
 
606 aa  75.5  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  28.4 
 
 
542 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  32.72 
 
 
518 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  35.42 
 
 
564 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  24.81 
 
 
534 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  30 
 
 
535 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  33.7 
 
 
583 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.49 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  29.46 
 
 
475 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  22.89 
 
 
539 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.27 
 
 
517 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.48 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  27.15 
 
 
511 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  30.37 
 
 
541 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  24.19 
 
 
523 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  29.72 
 
 
546 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  28.43 
 
 
519 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  34.07 
 
 
548 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  24.2 
 
 
523 aa  68.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  38.74 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  27.95 
 
 
542 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  30.14 
 
 
515 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  33.56 
 
 
526 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  28.04 
 
 
523 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  29.72 
 
 
539 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  24.65 
 
 
535 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  28.44 
 
 
509 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  25.31 
 
 
496 aa  66.6  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 
540 aa  66.6  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3094  recombinase  32.93 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  23.94 
 
 
522 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  23.99 
 
 
541 aa  66.2  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  26.18 
 
 
554 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  28.11 
 
 
442 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  28.16 
 
 
523 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  30.93 
 
 
542 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  24.21 
 
 
494 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 
510 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  28.99 
 
 
518 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  31.76 
 
 
521 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  27.67 
 
 
626 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 
519 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23.77 
 
 
534 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  28.77 
 
 
515 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  28.99 
 
 
540 aa  63.5  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  35.33 
 
 
548 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  35.33 
 
 
548 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  35.33 
 
 
548 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  24.47 
 
 
430 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  22.34 
 
 
522 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  28.31 
 
 
526 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  29.85 
 
 
552 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.31 
 
 
563 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  23.27 
 
 
550 aa  60.8  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  26.11 
 
 
586 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2698  hypothetical protein  35.4 
 
 
194 aa  60.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  28.11 
 
 
543 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  22.69 
 
 
462 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  29.59 
 
 
556 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.95 
 
 
558 aa  59.7  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  34.86 
 
 
277 aa  59.7  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  30.67 
 
 
465 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  28.57 
 
 
563 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  28.77 
 
 
613 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  30.38 
 
 
465 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>