179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0365 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 299 aa  606  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  36.01 
 
 		 564 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  36.01 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  35.69 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  35.69 
 
 		 349 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  35.69 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  35.69 
 
 		 516 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  35.37 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  35.69 
 
 		 513 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  40.64 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  33.23 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.33 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  34.81 
 
 		 354 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  38.93 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  34.18 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  33.53 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  34.41 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  35.25 
 
 		 354 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  35.87 
 
 		 351 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  34.8 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  34.8 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  32.82 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  27.39 
 
 		 340 aa  112  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  29.9 
 
 		 359 aa  89.7  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  30.33 
 
 		 377 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  29.87 
 
 		 362 aa  86.3  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  30.37 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  30.14 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  30.14 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  27.34 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.57 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  26.84 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  29.38 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  26.98 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  29.38 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  28.47 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  25.65 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.92 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  27.06 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  26.61 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.78 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  24.51 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  22.41 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.57 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  31.73 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  30.77 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  29.86 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.11 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  31.55 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.44 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  29.86 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  29.86 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  25.74 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  27.7 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.74 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  29.91 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  30.66 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  24.73 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  26.69 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  29.58 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  24.73 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  29.27 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  28.84 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  28.64 
 
 		 687 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  32.7 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  24.88 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  26.19 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  27.62 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1724  squalene/phytoene synthase  29.17 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  28.5 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  25.81 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  24.89 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  30.32 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  22.34 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  26.06 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.3 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  31.07 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  24.77 
 
 		 456 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  29.67 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  28.78 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  24.22 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  26.85 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  27.49 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2684  squalene/phytoene synthase  28.29 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  28.5 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  26 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  26.24 
 
 		 348 aa  52.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0017  squalene/phytoene synthase  29.27 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  27.19 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  27.1 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  24.44 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  23.77 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4139  squalene synthase HpnD  26.11 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  32.69 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  29.17 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0701  Squalene/phytoene synthase  22.37 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  31.5 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  28.1 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3572  Phytoene synthase  29.19 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  28.23 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>