88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5411 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 873 aa  1608    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  44 
 
 		 890 aa  478  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  43.82 
 
 		 890 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  40.02 
 
 		 897 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  42.12 
 
 		 902 aa  385  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  42.03 
 
 		 874 aa  341  4e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  38.39 
 
 		 595 aa  278  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  38.84 
 
 		 848 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 880 aa  271  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 		 811 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  34.26 
 
 		 905 aa  189  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  34.61 
 
 		 883 aa  181  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  40.43 
 
 		 811 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 916 aa  155  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  36.78 
 
 		 751 aa  149  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  31.4 
 
 		 689 aa  140  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  35.51 
 
 		 814 aa  99.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  31.48 
 
 		 861 aa  95.5  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  35.21 
 
 		 717 aa  86.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.86 
 
 		 2741 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.86 
 
 		 2741 aa  77  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 846 aa  74.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  24.44 
 
 		 809 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  34.48 
 
 		 827 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  31.98 
 
 		 992 aa  65.1  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  32.56 
 
 		 903 aa  64.7  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 1409 aa  64.3  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.62 
 
 		 532 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1544 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 729 aa  61.6  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.25 
 
 		 1007 aa  61.2  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 1621 aa  61.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 822 aa  58.9  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1162 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.11 
 
 		 1162 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 868 aa  57.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.64 
 
 		 782 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 1276 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  24.44 
 
 		 918 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 885 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  33.74 
 
 		 1051 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.1 
 
 		 828 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  21.04 
 
 		 854 aa  56.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1365 aa  55.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  32.51 
 
 		 1077 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1025 aa  55.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.48 
 
 		 968 aa  54.7  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  22.81 
 
 		 1328 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  23.36 
 
 		 919 aa  54.3  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  21.24 
 
 		 1060 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  32.5 
 
 		 447 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.2 
 
 		 957 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 937 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  24.8 
 
 		 1266 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 1247 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 1779 aa  51.6  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25 
 
 		 1009 aa  51.6  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.35 
 
 		 991 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1104 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1241 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  32.97 
 
 		 371 aa  50.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 1711 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1096 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  30.08 
 
 		 565 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1154  hypothetical protein  37.17 
 
 		 994 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 923 aa  49.7  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1142 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 750 aa  49.3  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1058 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  24.11 
 
 		 621 aa  48.5  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.71 
 
 		 836 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 1450 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 412 aa  47.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  30.21 
 
 		 959 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  24.62 
 
 		 985 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  29.13 
 
 		 928 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.81 
 
 		 2145 aa  46.6  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  22.85 
 
 		 1215 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.08 
 
 		 1238 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1063 aa  46.2  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1147 aa  45.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 850 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 1261 aa  45.4  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1441 aa  45.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 804 aa  45.1  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 349 aa  44.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.75 
 
 		 1022 aa  45.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  25.84 
 
 		 1247 aa  44.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>