173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1500 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  945    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  52.94 
 
 		 475 aa  490  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  46.9 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  46.68 
 
 		 477 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 477 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  46.04 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  47.28 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  46.15 
 
 		 472 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  44.3 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  43.95 
 
 		 480 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6436  transcriptional regulator, XRE family  42.89 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  43.95 
 
 		 480 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 481 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  43.74 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  43.87 
 
 		 472 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 483 aa  363  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 483 aa  361  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3514  XRE family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 471 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  42.16 
 
 		 474 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 482 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2077  transcriptional regulator, XRE family  43.27 
 
 		 490 aa  344  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 491 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 469 aa  343  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  40.13 
 
 		 475 aa  342  9e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 474 aa  342  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1626  XRE family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 476 aa  341  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.928013  normal  0.297966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  42.43 
 
 		 470 aa  340  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  39.87 
 
 		 475 aa  339  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 464 aa  339  7e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28370  predicted transcriptional regulator  39.87 
 
 		 475 aa  339  8e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1637  XRE family transcriptional regulator  43.47 
 
 		 490 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.375822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  39.96 
 
 		 482 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 477 aa  335  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  40.59 
 
 		 474 aa  332  9e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  42.68 
 
 		 477 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  41.79 
 
 		 524 aa  330  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  41.01 
 
 		 474 aa  330  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  40.39 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  39.29 
 
 		 475 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 461 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 475 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  39.29 
 
 		 475 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  41.52 
 
 		 461 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  41 
 
 		 506 aa  324  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  41.45 
 
 		 461 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 486 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1350  hypothetical protein  41.49 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 473 aa  320  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3788  transcriptional regulator, XRE family  39.04 
 
 		 477 aa  318  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.432624 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1217  XRE family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 495 aa  316  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  38.28 
 
 		 467 aa  309  6.999999999999999e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3669  transcriptional regulator, XRE family  38.64 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  41.47 
 
 		 484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2007  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464836  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  38.25 
 
 		 468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  42.92 
 
 		 461 aa  303  6.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2531  transcriptional regulator, XRE family  41.41 
 
 		 479 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1813  hypothetical protein  39.96 
 
 		 474 aa  302  8.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  39.87 
 
 		 464 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0218  transcriptional regulator, XRE family  41.97 
 
 		 455 aa  293  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999471 
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 470 aa  286  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 470 aa  286  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  39.16 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 464 aa  282  8.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0818  transcriptional regulator  41.31 
 
 		 469 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3158  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 472 aa  276  7e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0309  hypothetical protein  39.07 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 463 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0406  transcriptional regulator, XRE family  38.14 
 
 		 469 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4189  XRE family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0115476  normal  0.171074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0374  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 469 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152873  decreased coverage  0.00046899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0944  XRE family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 462 aa  229  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2985  DNA-binding protein  45.93 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.765892  normal  0.231078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1405  transcriptional regulator  28.6 
 
 		 431 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.9 
 
 		 481 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  29.48 
 
 		 478 aa  101  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 490 aa  91.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  29.95 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  29.29 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 		 504 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  26.38 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  27.78 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  27.97 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  27.34 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  28.82 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  26.47 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1510  XRE family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.899196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  25.96 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1471  helix-turn-helix domain-containing protein  25.75 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.772154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0387  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.612976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  27.3 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  26.62 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  24.92 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  44.16 
 
 		 428 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>