More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1324 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1324  2-alkenal reductase  100 
 
 
469 aa  907    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  42.71 
 
 
513 aa  283  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  42.71 
 
 
513 aa  283  6.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  41.84 
 
 
520 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  39.57 
 
 
487 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  44.82 
 
 
524 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  44.82 
 
 
524 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  39.22 
 
 
483 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  41.39 
 
 
498 aa  276  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  38.71 
 
 
500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  39 
 
 
498 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  43.66 
 
 
508 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.46 
 
 
483 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  38.94 
 
 
501 aa  273  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  42.18 
 
 
483 aa  272  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  40.05 
 
 
528 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  44.16 
 
 
520 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  41.34 
 
 
502 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  37.61 
 
 
497 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  41.06 
 
 
535 aa  268  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  40.54 
 
 
471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  36.24 
 
 
517 aa  266  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  42.01 
 
 
504 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  39.84 
 
 
527 aa  266  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  42.94 
 
 
588 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  43.15 
 
 
485 aa  265  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  42.81 
 
 
578 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  38.89 
 
 
493 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  37.87 
 
 
496 aa  264  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  40.83 
 
 
491 aa  263  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  38.53 
 
 
501 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  38.89 
 
 
506 aa  262  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.01 
 
 
506 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.01 
 
 
493 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  40.4 
 
 
499 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  45.22 
 
 
498 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  35.79 
 
 
508 aa  259  9e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  37 
 
 
499 aa  259  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  41.62 
 
 
514 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  40.68 
 
 
524 aa  256  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  40.53 
 
 
496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  38.44 
 
 
491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  40.7 
 
 
509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  47.25 
 
 
497 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  40.85 
 
 
496 aa  253  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.1 
 
 
464 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  39.32 
 
 
528 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  37.7 
 
 
527 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  40.16 
 
 
508 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  39.34 
 
 
525 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  37.04 
 
 
505 aa  251  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  36.92 
 
 
523 aa  251  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  37.37 
 
 
501 aa  251  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  35.59 
 
 
520 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  37.71 
 
 
457 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  35.21 
 
 
466 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  40.58 
 
 
496 aa  250  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  39.11 
 
 
526 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  34.92 
 
 
459 aa  250  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  38.02 
 
 
516 aa  250  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  39.01 
 
 
529 aa  249  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  40.26 
 
 
503 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  42.02 
 
 
462 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40 
 
 
464 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  38.32 
 
 
528 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  40.26 
 
 
503 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  37.24 
 
 
527 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  46.97 
 
 
522 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  35.92 
 
 
476 aa  246  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  35.79 
 
 
476 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  41.11 
 
 
500 aa  246  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  36.32 
 
 
474 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  39.67 
 
 
501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  40.6 
 
 
516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  40.79 
 
 
524 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  36.29 
 
 
473 aa  244  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.79 
 
 
476 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  36.72 
 
 
523 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  35.81 
 
 
501 aa  243  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  39.55 
 
 
481 aa  243  7e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  38.38 
 
 
537 aa  243  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  38.54 
 
 
523 aa  243  7.999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  39.34 
 
 
511 aa  242  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  44.86 
 
 
501 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  41.92 
 
 
502 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  40.98 
 
 
480 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  43.21 
 
 
396 aa  240  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  38.01 
 
 
497 aa  239  8e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  40.48 
 
 
515 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  46.57 
 
 
511 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  35.75 
 
 
471 aa  238  2e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  39.84 
 
 
475 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  46.57 
 
 
511 aa  238  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  37.62 
 
 
458 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  34.37 
 
 
479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  36.96 
 
 
485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  35.54 
 
 
476 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  38.89 
 
 
482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  34.59 
 
 
477 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  36.69 
 
 
474 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>