More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4008 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  81.93 
 
 		 1677 aa  2610    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  74.85 
 
 		 1679 aa  2306    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1791 aa  3614    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  37.38 
 
 		 1525 aa  843    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  94.21 
 
 		 1770 aa  2958    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  41.47 
 
 		 1509 aa  529  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  41.47 
 
 		 1528 aa  528  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  31.13 
 
 		 1490 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  33.9 
 
 		 1398 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  34.13 
 
 		 1400 aa  367  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  32.85 
 
 		 1429 aa  363  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  30.21 
 
 		 1268 aa  361  6e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  34.41 
 
 		 1426 aa  361  7e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  34.17 
 
 		 1405 aa  360  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  34.29 
 
 		 1426 aa  359  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1426 aa  359  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  33.14 
 
 		 1251 aa  356  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  32.95 
 
 		 1409 aa  352  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  32.99 
 
 		 1399 aa  352  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  32.95 
 
 		 1394 aa  351  7e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  32.99 
 
 		 1397 aa  349  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  33.26 
 
 		 1410 aa  348  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1411 aa  347  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  32.95 
 
 		 1411 aa  346  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1411 aa  346  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  33.22 
 
 		 1411 aa  347  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  32.61 
 
 		 1388 aa  346  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1397 aa  345  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  32.61 
 
 		 1308 aa  345  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  32.95 
 
 		 1411 aa  345  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  33.03 
 
 		 1417 aa  345  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  32.95 
 
 		 1397 aa  344  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  32.72 
 
 		 1377 aa  343  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  32.72 
 
 		 1411 aa  343  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  33.09 
 
 		 1377 aa  343  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  32.84 
 
 		 1365 aa  343  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  33 
 
 		 1405 aa  343  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  32.72 
 
 		 1397 aa  339  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  34.42 
 
 		 1388 aa  337  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  32.35 
 
 		 1415 aa  325  6e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  35.38 
 
 		 713 aa  265  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  30.72 
 
 		 1319 aa  241  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1317 aa  240  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  29.02 
 
 		 1199 aa  197  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  29.87 
 
 		 1216 aa  195  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  29.7 
 
 		 1200 aa  193  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  27.12 
 
 		 1583 aa  190  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  30.9 
 
 		 1626 aa  179  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  28.3 
 
 		 1602 aa  176  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  29.86 
 
 		 1620 aa  173  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  27.1 
 
 		 1604 aa  173  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.34 
 
 		 1362 aa  164  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  29.04 
 
 		 586 aa  159  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  32.97 
 
 		 477 aa  159  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  33.33 
 
 		 554 aa  158  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  33.06 
 
 		 502 aa  157  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  33.06 
 
 		 682 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  32.97 
 
 		 477 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  32.97 
 
 		 477 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  32.97 
 
 		 477 aa  155  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  32.97 
 
 		 477 aa  155  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  32.97 
 
 		 477 aa  155  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21.61 
 
 		 2035 aa  149  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.81 
 
 		 2277 aa  146  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1586 aa  137  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1229 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  64.49 
 
 		 290 aa  128  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  64.49 
 
 		 290 aa  128  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  32.04 
 
 		 1554 aa  127  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  28.54 
 
 		 1981 aa  123  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.57 
 
 		 3027 aa  122  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.05 
 
 		 2149 aa  121  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  50.44 
 
 		 451 aa  121  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  28.37 
 
 		 1573 aa  121  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  49.18 
 
 		 480 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1531 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  49.61 
 
 		 1609 aa  119  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  50.45 
 
 		 171 aa  118  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  27.43 
 
 		 1429 aa  118  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  32.29 
 
 		 1385 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  40.7 
 
 		 1551 aa  116  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3794  Rhs family protein  41.67 
 
 		 357 aa  115  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  48.65 
 
 		 1409 aa  115  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  26.66 
 
 		 1419 aa  115  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  46.56 
 
 		 312 aa  115  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  21.32 
 
 		 2096 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  40.7 
 
 		 583 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  50.43 
 
 		 1550 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  45.38 
 
 		 1386 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  50.46 
 
 		 867 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3796  YD repeat-containing protein  32.45 
 
 		 422 aa  114  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.982597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  49.57 
 
 		 866 aa  113  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  27.71 
 
 		 1485 aa  112  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  45.8 
 
 		 314 aa  112  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  45.8 
 
 		 314 aa  112  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  31.27 
 
 		 414 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  47.75 
 
 		 561 aa  112  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  44.92 
 
 		 1400 aa  112  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  45.04 
 
 		 314 aa  111  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  50 
 
 		 1614 aa  111  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>